血液检测在早期癌症检测和分类

癌症首席研究员博士领导的科学家丹尼尔·德·卡瓦略在玛格丽特公主癌症中心结合液体活检,表观遗传变化和机器学习开发一个血液测试来检测和分类癌症在早期阶段。

研究结果,发表在自然,描述不仅检测癌症的方法,但早些时候举行的承诺能够找到它时更容易处理和之前的症状出现,卡瓦略·博士说癌症中心的资深科学家,大学健康网络。

“我们很兴奋在这个阶段,”De卡瓦略博士说。“癌症是如何检测它的一个严重问题。这是一个“针”问题如何发现血液中十亿分之一的癌症特异性突变,特别是在早期阶段,血液中肿瘤DNA的数量是最少的。”

通过分析表观遗传改变而不是突变,团队能够识别成千上万的修改每个癌症类型所特有的。然后,他们使用大数据的方法,应用机器学习创建分类器能够识别cancer-derived DNA的存在在血液样本和确定癌症类型。这基本上把“干草堆针之一”的问题成为一个可以解决的“成千上万的针在干草堆,”,计算机只需要找到几针定义哪些干草堆针。

科学家追踪癌细胞起源和类型通过比较300七疾病病人的肿瘤样本网站(肺癌、胰腺癌、大肠癌、乳腺癌、白血病、膀胱和肾脏)和健康的捐赠者的样本分析血浆中游离循环DNA。在每个样本中,血浆DNA匹配肿瘤DNA“浮动”。团队已经扩展研究,现在异形和成功匹配的700多个肿瘤和血液样本更多的癌症类型。

在实验室之外,下一步进一步验证这种方法包括分析数据从大型人口健康研究已经在几个国家,在收集血液样本癌症诊断之前几个月到几年。然后需要最终确认的方法前瞻性研究癌症筛查。

De卡瓦略博士是一个训练有素的免疫学家(巴西圣保罗大学)博士后训练在癌症表观基因组学(美国大学(University of Southern California)的研究侧重于癌症表观遗传学。他拥有的加拿大研究主席癌症表观遗传学和表观遗传治疗和癌症表观遗传学副教授,多伦多大学医学生物物理学系。

研究由多伦多大学的迈克劳林中心,加拿大卫生研究院的研究中,加拿大癌症协会,安大略癌症研究所通过安大略省和玛格丽特公主癌症基金会。

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