蛋白质组学技术突破片™收购提供了全球科学界

瑞士苏黎世联邦理工学院的科学家以及AB SCIEX已经完成了他们的开发/姆梭尔女士的片™收购,大规模spectrometry-based蛋白质组学技术,量化样品中几乎所有的肽和蛋白质从单个分析。今年的方法发表在分子和细胞蛋白质组学。

液相色谱耦合串联质谱(LC / MS / MS)由蛋白质组学研究人员广泛使用,但是目前的方法不提供速度、定量准确性、特异性、灵敏度和重现性所必需的完整和定量蛋白质组生物系统的地图。

第一次片™收购使用data-independent MS / MS收购方法系统地生成完整的、高度专一碎片离子可以查询地图,是否存在任何感兴趣的蛋白质的数量和使用有针对性的数据分析策略。

新方法取决于一个先进的混合quadrupole-time飞行质谱仪的AB SCIEX TripleTOF™5600系统。

高分辨率的独特组合,质量准确性和超高MS / MS谱采集率意味着它是唯一的质谱仪的方法可以有效地执行。

片™收购TripleTOF 5600系统,AB SCIEX /姆梭尔女士的扩展功能,很快将商用和开发作为合作的一部分,AB SCIEX博士Ruedi Aebersold和他的团队在苏黎世联邦理工学院。

”片™收购让我们探索多路复用MS / MS数据集的水平是不可能与传统集群或数据库方法,“说Ruedi Aebersold,博士,教授,分子系统生物学研究所瑞士联邦理工学院苏黎世联邦理工学院。

Aebersold继续说道,“通过与AB SCIEX合作开发的技术TripleTOF™5600年,我们取得了这一突破性的方法可用于蛋白质组学研究人员对整个蛋白质组进行综合定量”。

技术生成高度特定的碎片离子数据对于所有的前体在监控范围内。

与传统的采购方法,这种技术不依赖于前体离子质检测触发MS / MS收购。

相反,它系统地碎片所有组件的示例通过快速移动的选择窗口。

从结果数据,一些高分辨率为每个肽片段离子色谱图可以提取感兴趣的集体确定目标肽,在选择或多反应监测(SRM / MRM)。

使用离子库MRMAtlas等公共资源,或通过数据库搜索软件生成的内部如ProteinPilot™软件,研究人员可以查询数据集一遍又一遍地对多肽/蛋白质定量数据。

这项技术提供了一个完整的定性和定量存档的样本,可以回顾审问在网上开发新的假设。