淡黄色的外套标本仍然可行的作为高度多路复用的DNA来源全基因组基因测试后长期存储

背景
血液样本采集处于早期研究访问通常是包含在观察性研究或临床试验分析二级结果的生物标志物。公共协议是为未来储存巴菲外套标本DNA隔离和这些可能保持在冷冻存储多年。它是不确定的,如果DNA仍适合现代全基因组协会(GWA)基因分型。

方法
我们分离DNA从120年控制糖尿病心血管风险行动(协议)临床试验巴菲外套抽样范围的存储* 9年和其他因素可能影响DNA的产量。我们执行TaqMan SNP基因分型结果和GWA测试DNA是否保留完整的高质量的遗传分析。

结果
我们测试了两个用于DNA试剂盒自动化协议隔离,宁愿损害血液协议尽管类似的收益率。我们从所有120个标本分离出DNA(屈服区域1.1 -312 ug / 8.5毫升ACD管全血)只有3/120的< 10 ug DNA样本。年龄与产量相关的参与者在抽血是消极的(平均-2.1 ug /年)变化。基于凝胶电泳QC DNA质量很好,6个snp基因分型结果TaqMan 702年基因型基础(这一幕率1.1%),和优秀的质量GWA基因分型数据(最大/样本基因缺失率0.64%)。

结论
当收集作为长期的临床试验或生物标本的DNA,淡黄色的外套可以存储9年在-80°C冻结状态,依然会产生高收益的DNA适合GWA分析和其他基因检测。

这篇文章发表在杂志上的转化医学和可以自由访问。