癌症重建染色体结构的优势

癌症重建我们的染色体疾病的架构可以保存和传播,弗吉尼亚大学的研究人员透露。

这种改造是很重要的,因为组件的安排在我们的染色体实际上影响的运作我们的基因。与这些翻新,癌症开始为自己做一个舒适的家在我们的细胞。

“即使DNA序列的遗传密码可能基本上保持不变,染色体的三维结构在癌症可能非常不同于我们的正常细胞,”研究员冲值藏说,博士的计算生物学家UVA中心的公共卫生基因组学。“更好的理解癌症基因组结构可以给我们开发新药物的见解来专门针对每个癌症的致命弱点。”

了解癌症

使其预期的变化在我们的染色体,癌症依赖于一种叫做“CCCTC-binding因素,”或CTCF的蛋白质。CTCF自然地发生在我们的细胞。在健康细胞,它扮演着一个重要的角色在维持染色体结构和在需要时打开和关闭基因。但藏发现癌症,劫持CTCF的目的。CTCF似乎不应该,也不应该绑定。这改变了我们的三维组织染色体和基因的工作方式变化。

理解CTCF在癌症中的作用,藏和他的团队深入到基因从人体组织和癌症样本中收集的数据。他们发现CTCF模式重构在六种不同的癌症,包括t细胞急性淋巴细胞白血病、急性骨髓性白血病、乳腺癌、大肠癌、肺癌和前列腺癌。

“我们开发了一个创新的数据科学方法收集和集成成千上万的公开数据集这些发现,“藏说。“这是令人兴奋的,看看有多少新的科学发现可以仅仅通过分析大数据的了。”

研究人员验证他们的发现,特别是在t细胞急性淋巴细胞白血病,但是他们说进一步研究变化为CTCF绑定将帮助科学家更好地理解其他癌症的起源。(错误CTCF绑定也一直与发育障碍和其他条件,因此了解这些疾病还可能提供重要的见解。)

“CTCF的异常模式绑定,我们发现可能是每个癌症类型中存在的一个签名,“藏说。“这些发现使我们的一小步接近完全解开癌症的分子机制,一种极其复杂的疾病。”

参考:方,C。王,Z。,汉族,c . et al .癌症特异性CTCF绑定促进致癌转录失调。基因组医学杂志。2020;21:247 doi:10.1186 / s13059 - 020 - 02152 - 7

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