HIV-1-Infected细胞显示的特点
消灭hiv - 1感染,一定要阐明的详细功能和异质性HIV-1-infected细胞体内。在这项研究中,一个造血干细胞cell-transplanted人源化小鼠模型感染hiv - 1基因修饰被用来揭示HIV-1-producing细胞体内的多个特征。
医学研究所的一个研究小组,东京大学(IMSUT)使用HIV-1-infected细胞执行“multiomics”分析,最近开发的技术全面调查生物样本的特性。
“我们的发现描述HIV-1-producing细胞体内的多个特征,这可能为hiv - 1治疗的发展提供线索。”佐藤说,首席科学家,祺,副教授(首席研究员)系统分部的病毒学,IMSUT传染性疾病控制部门。
这项研究的结果发表在细胞的报道2020年7月14日。
研究“hiv - 1疗法”
消灭hiv - 1感染,重要的是要获得广泛的特点的深入理解HIV-1-infected细胞体内。
最近开发的“组学”分析(* 1)可以是一个强大的工具来识别HIV-1-infected细胞的特点。然而,应该注意的是,绝大多数的CD4 + T细胞(* 2)感染者的感染,因此,“批量”的转录概况CD4 + T细胞在体内不能反映的“纯”HIV-1-producing细胞。
Multiomics分析,全面揭示HIV-1-infected细胞体内的特点
在这项研究中,研究小组使用了一个人类造血干细胞cell-transplanted人源化小鼠模型,保持相对稳定的免疫条件下人类白细胞生成体内和replication-competent记者hiv - 1,和使用四个最近开发的技术来研究病毒基因组学和转录组。
本研究根据研究小组,由四个以下分析:
首先,液滴数字PCR显示感染了人源化小鼠的潜在储层的存在。其次,连接介导PCR显示hiv - 1整合到开放的染色质区域的偏好,协会所显示的表观遗传修饰病毒生产集成网站。第三,数字RNA-sequencing量化绝对拷贝数HIV-1-producing细胞体内的病毒记录之间的差异表达基因,并进一步确定了病毒感染和未感染的细胞。最后,单细胞RNA-sequencing透露和特征的异质性HIV-1-producing细胞体内。
副教授佐藤强调“据我们所知,本研究是第一个调查描述HIV-1-producing细胞的多个方面,也第一次全面调查HIV-1-infected细胞体内”的特点。
参考:麻生太郎H。长冈,S。川上E。伊藤,J。伊斯兰教,S。棕褐色,b . J。,。佐藤,k (2020)。Multiomics调查揭示HIV-1-Infected细胞体内的特点。细胞的报道32 (2),107887。doi: 10.1016 / j.celrep.2020.107887
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