1000年芝加哥癌症基因组计划研究遗传学肿瘤
阅读时间:
没有两个肿瘤相似,但癌症遗传学的分析从身体的不同部位可能揭露了令人震惊的细节用于治疗和预防。
这个过程已经获得牵引芝加哥大学的基因组学和系统生物学研究所(IGSB),那里的研究人员正一年为期三年的项目,收集和分析每一个基因的基因序列和变化表示到1000年肿瘤。
在过去的一年里,与医生密切合作,IGSB团队收集完整的序列数据100年基因表达的肿瘤,主要是乳腺癌,头部和颈部癌症和白血病。关联与病人基因数据的结果,他们已经开始识别遗传模式内的肿瘤可能帮助他们预测癌症将如何表现。许多专家认为这类信息将越来越多地指导治疗。
说:“这一长期目标IGSB导演凯文•白教授詹姆斯·弗兰克和卡伦家族在人类遗传学和生态学与进化,“是基因的发现转化为有用的诊断工具和治疗策略。这应该改善病人的治疗。”
不要混淆“1000人基因工程”——一个国际努力所有的DNA序列从1000个人选择来自世界各地数以百计的不同的人群——芝加哥1000 -癌症基因组项目是完全建立在芝加哥大学和紧密关注这个共同的遗传疾病。
“芝加哥癌症基因组计划旨在教我们如何使用基因治疗的细胞作为路标状态应该提供特定的病人,”怀特说。
癌症是一种基因疾病。每个肿瘤的基因疾病的严重程度提供线索。他们有时可以预测癌症是否会回复具体的治疗方法,开发抗放疗或化疗,治疗后复发,或扩散到一个遥远的网站。
许多老牌癌症治疗的遗传信息,开始在芝加哥大学的埃尔伍德詹森1958年发现的雌激素受体,导致雌激素受体阻滞剂如他莫昔芬的发展,和珍妮特罗利的描述在1972年第一次染色体易位,工作导致靶向治疗被称为格列卫。
但芝加哥癌症基因组项目第一批努力结合关注大规模的基因表达的多种癌症,系统的实现。在试点阶段——从第一个100肿瘤表达基因测序团队建立和完善项目框架利用最新的基因序列分析技术和计算分析。
“我们现在知道该怎么做,”怀特说。“我们的基本结构。在这个过程中,我们已经确定了小说与临床结果在选定的癌症相关的基因。”
接下来的步骤是确定这些基因改变和扩大项目包括更多的肿瘤类型,包括膀胱肿瘤、肺、胰腺、前列腺、以及几个童年癌症横纹肌肉瘤和神经母细胞瘤等。
分析各种肿瘤可能揭示未知的遗传相似性癌症通常分为不同的起源,根据组织怀特说。
癌症的基因可能非常复杂,米歇尔LeBeau说,博士,芝加哥大学癌症研究中心的主任。“凯文的团队IGSB带来正确的工具,”她说。“他们有能力收集和处理大量的基因数据,不仅能力研究单个基因的整个遗传途径及其相互作用,与多个团队的工作关系密切的癌症专家。”
芝加哥方法不同于几个大型癌症基因组的努力进步。一年前,来自华盛顿大学的研究小组发表的第一个癌症基因组,白血病患者。自那时以来,基因组乳腺癌、黑色素瘤和肺癌出现,国家癌症研究所是编译其癌症基因组图谱。
只与这些项目不同的是,芝加哥的研究人员将研究这些肿瘤表达的基因——一个个体的基因组的百分之二——但会收集更多的肿瘤的基因数据。
“如果我们消除98%的基因组,使其50倍更便宜、更容易,”怀特说。”,仍然是相当多的DNA,”他强调,相当于20整个基因组,约600亿个碱基对。收集了来自1000位肿瘤的遗传信息将花三年的时间,他说,但是它将提供的信息”可以更迅速被应用到临床问题的答案。”
该项目还将收集基因数据基因表达的肿瘤如何随时间而变化。只要有可能,研究者将比较肿瘤样本取自病人之前和之后的治疗,癌症学会积累额外的基因变化,使他们能够抵御放疗或化疗或扩散到遥远的网站。
所有的病人都必须为他们的组织提供事先同意记录和研究。因为研究人员关注的基因线索如何预测癌症的行为,团队是每个病人的进步通过他或她的临床过程。
大多数病人一直希望捐赠表示,癌症专家凯文•Roggin医学助理教授手术,他们为每一个患者胰腺癌提供了机会作出贡献的项目,随着时间的推移,取得更好的治疗和结果。
“它已经开始帮助,”他补充道。“我们积累数据,我们希望发展成一个分子指纹,DNA档案,可以帮助我们预测哪些胰腺囊性肿瘤可能仍是良性的,哪些会发展成癌症。”
捐赠肿瘤组织不需要额外的努力或费用的病人,Roggin说。“首先,我们确保我们不妥协做出诊断病理学家的能力。第二,如果有额外的组织,我们快速冷冻零下80度和日志到数据库。然后我们可以无限期地存储组织,我们需要生成DNA和RNA的。”
项目网格与医学中心的成立程序在癌症药物基因组学,研究某些基因变异如何影响病人应对各种抗癌药物和基因测试来预测发展的副作用。
“通过研究肿瘤和病人我们将越来越多地可以设计最佳治疗策略提供了最好的希望控制癌症病人最少的毒性,”理查德·斯勒斯基说,医学博士,教授,医学和血液学/肿瘤学的首席医疗中心和过去的美国临床肿瘤学会主席。
“这是一个漫长的道路从一块改善病人护理的基因组序列,“白色的警告。“但发现的道路是明确的。在许多情况下,我们知道足够现在连接的点。”
这个过程已经获得牵引芝加哥大学的基因组学和系统生物学研究所(IGSB),那里的研究人员正一年为期三年的项目,收集和分析每一个基因的基因序列和变化表示到1000年肿瘤。
在过去的一年里,与医生密切合作,IGSB团队收集完整的序列数据100年基因表达的肿瘤,主要是乳腺癌,头部和颈部癌症和白血病。关联与病人基因数据的结果,他们已经开始识别遗传模式内的肿瘤可能帮助他们预测癌症将如何表现。许多专家认为这类信息将越来越多地指导治疗。
说:“这一长期目标IGSB导演凯文•白教授詹姆斯·弗兰克和卡伦家族在人类遗传学和生态学与进化,“是基因的发现转化为有用的诊断工具和治疗策略。这应该改善病人的治疗。”
不要混淆“1000人基因工程”——一个国际努力所有的DNA序列从1000个人选择来自世界各地数以百计的不同的人群——芝加哥1000 -癌症基因组项目是完全建立在芝加哥大学和紧密关注这个共同的遗传疾病。
“芝加哥癌症基因组计划旨在教我们如何使用基因治疗的细胞作为路标状态应该提供特定的病人,”怀特说。
癌症是一种基因疾病。每个肿瘤的基因疾病的严重程度提供线索。他们有时可以预测癌症是否会回复具体的治疗方法,开发抗放疗或化疗,治疗后复发,或扩散到一个遥远的网站。
许多老牌癌症治疗的遗传信息,开始在芝加哥大学的埃尔伍德詹森1958年发现的雌激素受体,导致雌激素受体阻滞剂如他莫昔芬的发展,和珍妮特罗利的描述在1972年第一次染色体易位,工作导致靶向治疗被称为格列卫。
但芝加哥癌症基因组项目第一批努力结合关注大规模的基因表达的多种癌症,系统的实现。在试点阶段——从第一个100肿瘤表达基因测序团队建立和完善项目框架利用最新的基因序列分析技术和计算分析。
“我们现在知道该怎么做,”怀特说。“我们的基本结构。在这个过程中,我们已经确定了小说与临床结果在选定的癌症相关的基因。”
接下来的步骤是确定这些基因改变和扩大项目包括更多的肿瘤类型,包括膀胱肿瘤、肺、胰腺、前列腺、以及几个童年癌症横纹肌肉瘤和神经母细胞瘤等。
分析各种肿瘤可能揭示未知的遗传相似性癌症通常分为不同的起源,根据组织怀特说。
癌症的基因可能非常复杂,米歇尔LeBeau说,博士,芝加哥大学癌症研究中心的主任。“凯文的团队IGSB带来正确的工具,”她说。“他们有能力收集和处理大量的基因数据,不仅能力研究单个基因的整个遗传途径及其相互作用,与多个团队的工作关系密切的癌症专家。”
芝加哥方法不同于几个大型癌症基因组的努力进步。一年前,来自华盛顿大学的研究小组发表的第一个癌症基因组,白血病患者。自那时以来,基因组乳腺癌、黑色素瘤和肺癌出现,国家癌症研究所是编译其癌症基因组图谱。
只与这些项目不同的是,芝加哥的研究人员将研究这些肿瘤表达的基因——一个个体的基因组的百分之二——但会收集更多的肿瘤的基因数据。
“如果我们消除98%的基因组,使其50倍更便宜、更容易,”怀特说。”,仍然是相当多的DNA,”他强调,相当于20整个基因组,约600亿个碱基对。收集了来自1000位肿瘤的遗传信息将花三年的时间,他说,但是它将提供的信息”可以更迅速被应用到临床问题的答案。”
该项目还将收集基因数据基因表达的肿瘤如何随时间而变化。只要有可能,研究者将比较肿瘤样本取自病人之前和之后的治疗,癌症学会积累额外的基因变化,使他们能够抵御放疗或化疗或扩散到遥远的网站。
所有的病人都必须为他们的组织提供事先同意记录和研究。因为研究人员关注的基因线索如何预测癌症的行为,团队是每个病人的进步通过他或她的临床过程。
大多数病人一直希望捐赠表示,癌症专家凯文•Roggin医学助理教授手术,他们为每一个患者胰腺癌提供了机会作出贡献的项目,随着时间的推移,取得更好的治疗和结果。
“它已经开始帮助,”他补充道。“我们积累数据,我们希望发展成一个分子指纹,DNA档案,可以帮助我们预测哪些胰腺囊性肿瘤可能仍是良性的,哪些会发展成癌症。”
捐赠肿瘤组织不需要额外的努力或费用的病人,Roggin说。“首先,我们确保我们不妥协做出诊断病理学家的能力。第二,如果有额外的组织,我们快速冷冻零下80度和日志到数据库。然后我们可以无限期地存储组织,我们需要生成DNA和RNA的。”
项目网格与医学中心的成立程序在癌症药物基因组学,研究某些基因变异如何影响病人应对各种抗癌药物和基因测试来预测发展的副作用。
“通过研究肿瘤和病人我们将越来越多地可以设计最佳治疗策略提供了最好的希望控制癌症病人最少的毒性,”理查德·斯勒斯基说,医学博士,教授,医学和血液学/肿瘤学的首席医疗中心和过去的美国临床肿瘤学会主席。
“这是一个漫长的道路从一块改善病人护理的基因组序列,“白色的警告。“但发现的道路是明确的。在许多情况下,我们知道足够现在连接的点。”
广告
