CIDR使用Illumina全基因组基因分型解决方案

Illumina公司日前，该公司宣布与美国遗传疾病研究中心(CIDR)使用Sentrix^®HumanHap300 BeadChip和Infinium™Assay用于2型糖尿病的初步研究。

这项研究的一个目标是评估Illumina技术是否可能被采纳为CIDR全基因组关联服务的标准平台，该服务将于2006年春季提供给科学界。

CIDR正在与Illumina合作，对芬兰-美国NIDDM遗传学调查研究(FUSION)提供的2500多个病例对照样本进行基因分型，这是一个国际研究合作项目。

由美国国立卫生研究院(国家卫生研究院)， FUSION团队的目标是绘制和识别使个体易患2型糖尿病(以前是非胰岛素依赖型糖尿病，或NIDDM)的遗传变异。

作为其技术评估工作的一部分，CIDR将使用Sentrix HumanHap300串珠芯片在单个微阵列设备上查询超过317,000个标签snp。

BeadChip由Illumina公司的Infinium检测技术提供动力，该技术能够智能选择和分析基因组中的几乎任何SNP。

Illumina声称，HumanHap300中SNP位点的高统计价值使研究人员能够实现市场上任何阵列的全面基因组覆盖。

据CIDR主任、约翰霍普金斯大学遗传医学研究所教授David Valle博士说:“CIDR致力于通过在其基因分型服务实验室中提供最强大的技术来服务于遗传学研究界。”

“这项试点研究让我们有机会调查和评估一个有前途的基因分型平台，该平台利用了HapMap DNA标记，旨在最大限度地提高我们识别疾病和特定DNA变异之间关联的能力。”

“我们选择2型糖尿病进行评估，是因为关于该疾病的现有遗传数据的丰富，以及参与FUSION项目的研究人员的统计和分析专业知识的力量。”

“我们期待着与Illumina和糖尿病团队合作，使这个试点项目成功而迅速地结束。”

Illumina首席执行官兼总裁Jay Flatley进一步评论了这项研究，他说:“在HapMap项目中识别tagSNPs为后续大规模疾病关联研究奠定了基础。”

“我们很高兴看到使用我们的新HumanHap300 BeadChip生成的重要基因分型数据，因为该芯片的内容是与HapMap的主要参与者合作开发的。”

“我们渴望与CIDR和FUSION团队合作进行2型糖尿病研究。”