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比较分析大规模光谱相似性措施全面GCxGC-MS峰对齐


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文摘
峰对齐是一个关键过程质量spectrometry-based代谢组学的生物标志物的发现。峰对齐方法之一综合二维气相色谱质谱(GC×GC - ms)数据峰值matching-based对齐。峰值matching-based对齐的关键是大规模光谱相似性的计算分数。各种质量光谱相似性度量开发主要为复合识别,但这些光谱相似性措施的影响的性能峰值matching-based对齐仍然未知。因此,我们选择了五个质量光谱相似性度量,cos相关性,皮尔逊相关性,斯皮尔曼相关,偏相关,和部分相关,研究了影响峰值对齐使用两套实验GC×GC - ms数据。结果表明,光谱相似性度量并不影响对准精度明显从更少的复杂样品的分析数据,而偏相关执行比其他光谱相似性度量分析从复杂的生物样本获得的实验数据。

这篇文章发表在计算和数学方法在医学和是免费访问。

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