比较数字PCR微流控和常规定量PCR检测拷贝数变异

文摘
的好处之一数字PCR (dPCR)是无与伦比的精度潜力使小褶皱变化测量。评估的一个例子,可能受益于这种改进的精度测量肿瘤相关拷贝数变异(CNV)的细胞自由DNA (cfDNA)病人血浆的分数。调查的潜在精度dPCR和比较它与建立定量PCR技术(qPCR),我们使用乳腺癌细胞系调查HER2基因扩增和模仿各种不同的基因拷贝数异变。我们与平等的实验表明,复制,dPCR CNV可以测量一个小于qPCR。dPCR精密直接依赖于复制的数量测量和模板浓度,我们还开发了一种方法来协助dPCR实验测量CNV的设计。使用现有的模型(基于泊松和二项分布)获得dPCR固有的方差的表达式,我们生产能力计算定义所需的实验规模可靠地检测到一个给定的褶皱变化在给定的模板浓度。这项工作将促进未来任何翻译dPCR关键诊断应用程序,比如癌症cfDNA的诊断和分析。

这篇文章发表在核酸研究和是免费访问。