计算机分析完成抗体蓝图

保护我们的身体免受入侵者的抗体。这些分子包括蛋白质与糖。然而,这些糖的蓝图指导处理蛋白质在直到现在不是很好理解。在《华尔街日报》发表的一篇论文自然通讯亥姆霍兹慕尼黑中心的科学家们使用计算机分析来完成这个蓝图和在实验室证实了他们的发现。

作者特别研究了免疫球蛋白抗体。*这是最常见的血液中抗体,尤其是对病毒和细菌。“他们有一个Y形特征,主要由蛋白质组成”,解释了Elisa的趣事,计算生物学研究所的博士生亥姆霍兹慕尼黑中心的(ICB)。“然而,在他们的生产,这些蛋白质分子细胞高度不同的糖,以及这如何发生直到现在不清楚”,继续这项研究的第一作者。

了解这个过程是研究人员极大的兴趣,因为糖的身份连接(这一过程称为糖基化)显著影响抗体的功能。虽然一个糖分子可能促进炎症接触抗原后,另一个可能会抑制免疫反应。

使用计算机来解决一个生化问题

“研究糖基化的困难蓝图谎言,除此之外,在复杂的调节相应的酶是如何工作的”,最后作者简Krumsiek博士解释说,青年在ICB组长和青年研究员慕尼黑工业大学。bioinformaticians的策略来解决这个困难的问题是生化反应来解决它在数字领域。

为此,科学家们分析了从克罗地亚10001斑点狗生物库的数据。他们首先研究了近700的血样测试对象年龄在18岁和88对糖连接到他们的免疫球蛋白抗体。通过调查的相关测量聚糖,作者发现,他们很大程度上与先前已知的步骤的酶免疫球蛋白g糖基化的过程。事实上,数据的基础上,该算法可以重建已知蓝图,并进一步开发它。

“我们可以预测新糖残基的步骤必须附加到抗体”,Krumsiek解释道。“用另外三个军团由超过2500个样品,我们可以复制统计数据。”Subsequently, the researchers could substantiate the predicted steps using further methods: firstly, on the basis of a genome-wide association study with about 1,900 samples from the Augsburg-based KORA research platform**, and, additionally, in a series of three experiments in the laboratory.

“我们可以显示至少一个体外预测反应的酶是可行的,我们证明在细胞培养中,特定的酶预测模型中一起工作,确实硝唑的细胞,也就是说,他们相互空间非常接近”,Krumsiek说。“我们的研究显示了信息技术和传统台式化学可以相互支持、相互提升。”

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