计算机程序检测到人体细胞之间的区别

“有多少不同的细胞在人体内?这些差异是如何发展?斯坦教授说:“没有人真正知道Aerts KU鲁汶/振动器但由于他的团队开发的一种新方法,可能要改变了。

虽然我们身体的每个细胞携带相同的DNA序列,有一个巨大的各种各样的细胞类型和功能。这些差异源于DNA序列是如何解释:不是所有的基因都是“开启”在每一个细胞。

寻找模式

单细胞测序的最新进展已经测量成为可能,我们的20000个基因活跃在单个细胞。超过30万亿细胞在人体内,这些技术提供了一个前所未有的水平的细节是生物学和医学研究带来了一场革命。但当这种方法应用于成千上万的细胞从不同的组织,它变得越来越有挑战性来处理大量的数据,发现有意义的模式。

计算生物学家斯坦Aerts (KU鲁汶/ VIB)和他的团队与数学家、工程师们,专家的挑战。“我们开发的景区,一个计算机程序,用来识别不同的细胞类型根据他们的基因表达模式,快速和准确。这样可以更好的理解细胞的命运是如何监管,和识别的主监管机构,这也可能是潜在的药物靶点。”

我们的方法可以帮助开发一个“阿特拉斯”我们身体的所有细胞。结果将是一个研究和医学信息的宝贵来源。

非常有价值的信息来源

“这新方法不仅帮助我们了解更多关于不同的细胞在体内,“博士后研究员萨拉Aibar桑托斯说。“这也告诉我们如何细胞活性的变化时间的课程,或者当我们生病。”

团队已经应用小鼠和人类的大脑组织的方法。他们还用它来分析和比较癌细胞从大脑和皮肤肿瘤,导致新细胞类型的识别与转移,癌细胞的扩散到身体的其他部位。

方法可以帮助发展人类细胞阿特拉斯,一个全球性的努力旨在映射所有人体不同的细胞类型和状态。“这阿特拉斯将是一个宝贵的信息来源为研究和医学、“Aibar桑托斯仍在继续。“这将使我们能够系统地研究与不同的疾病相关的生物变化,了解疾病相关基因是活跃在我们的身体,分析生产和管理活动的分子机制不同的细胞类型,并找出如何不同的细胞结合,共同形成组织”。

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参考:

Aibar, s . et al。(2017)风景:单细胞监管网络推理和集群、自然的方法。DOI: 10.1038 / nmeth.4463