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传达与CLC生物团队,提供特殊的基因组学分析


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传达与CLC基因组学的计算架构的集成服务器和CLC基因组工作台为基因组学研究提供了独特的优势。“CLC生物的组合,传达给我们的研究人员易于使用的访问性能,他们需要处理我们的大型测序项目,”罗伯特•Geffers博士说HZI的基因组分析集团(GMAK)。“集成解决方案是强大的和提供了一个极好的用户体验,使我们的研究更富有成效。”

“我们有大量的测序项目并行运行,需要处理数据非常快,但我们对电脑的空间是有限的。传达解决这两个问题都通过提供高性能、紧凑的大小,并与刀片我们已经轻松集成,“Geffers博士说。“此外,我们的许多分析管道之前需要使用命令行和脚本,可以让研究者和临床医生难以处理。CLC生物用户界面可以消除这些障碍,使膨胀工具套件的研究者的手中。”

HZI 18亥姆霍兹协会是一个中心追求广泛的科学学科。功能为核心的GMAK设施——不断扩大的下一代测序服务的提供者与内部和外部合作伙伴。其多样化的活动包括分析基因组、外遗传性和病原体和宿主细胞转录组变化。

”传达的架构大大增加了分析研究中心癌症和传染病的能力,以及其他地区农业研究。所有这些领域需要极高的吞吐量基因组分析,处理生成的测序数据量非常巨大,”博士说Jannick Bendtsen,咨询解决方案总监CLC生物。与表达“这是非常积极的工作,整合他们的知识与我们的算法能力满足高性能计算的需求我们共同的客户。”

”传达很高兴与CLC生物合作推进现代基因组学和为客户提供完整的解决方案和亥姆霍兹感染研究中心“乔治Vacek博士指出,主任传达计算机的生命科学业务单元。“CLC生物综合套件的易于使用的算法和工作流的指尖带来强大的分析不仅bioinformaticians,而且生物学家和临床医生。”

传达的hybrid-core架构对经典英特尔(R)处理器和fpga组成的协处理器。特定的算法——DNA序列组装,例如——优化和翻译成可加载到fpga的代码在运行时,大大加速性能关键型应用程序。

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