CRISPR-BEST,新的放线菌基因组编辑工具
尽管CRISPR技术允许更好的操纵基因对现代药物开发和与许多积极作用的发现新的更好的抗生素、重大问题,如基因组不稳定性和毒性Cas9-protein仍在使用的技术。
但在一项新的研究发表在PNAS之外,科学家们提出一个新的承诺叫做CRISPR-BEST CRISPR工具包。这个工具的运作与一个有效的方法来创建突变放线菌无需DNA双链断裂。
因此,CRISPR-BEST系统地址放射菌类细菌的基因工程的一个主要挑战因为引入双链断裂通常创建遗传不稳定力量重新排列的细菌,甚至删除大部分地区的染色体。这种现象时要避免工程细胞能够产生生物活性化合物和新的抗生素。
“CRISPR-BEST解决一些目前CRISPR技术相关的主要问题。这可能是一个大步的方向更好的利用生物技术的潜力如代谢工程和合成生物学,依赖于遗传基因操作和编辑,“Yaojun通说,诺和诺德基金会研究员Biosustainability中心差Biosustain。
最好的两个世界
这个想法发展CRISPR-BEST之前,研究人员希望利用传统CRISPR方法灭活一个特定的基因,以产生新的抗生素黄色霉素的变体。而是灭活只有所需的基因,他们失去了大的部分染色体在这些实验中,总共超过130万个碱基对。因此,他们开始寻找方法来获取CRISPR锋利的效率,但同时避免染色体的乳沟,这可能导致很大的缺失。
他们看到CRISPR-BEST作为一个成功的尝试把两个世界的好处。
“我们维护CRISPR的效率,这很容易让我们感兴趣的目标基因。但另一方面,我们现在可以使用非常温和条件引入将引入更少压力的突变细胞,从而避免抗生素的基因不稳定性产生细菌,”韦伯岁说教授和诺和诺德基金会Co-PI Biosustainability中心差Biosustain。
进一步优化前
CRISPR-BEST大的第一步是正确的方向,但目前科学家们正在研究如何进一步提高编辑效率和增加基因组编辑的数量,可以同时完成。这些发展可能与使用机器人,可以处理大量样品铺平了道路做基因组编辑在未来更高的数字。
”系统代谢工程的放线菌,抗生素的最佳生产商和其他生物活性化合物,只有少数基因工具所需的吞吐量和可伸缩性,系统代谢工程方法——所以,我们现在有一个新的工具包已经是一种优势,”Yaojun通说。
参考:通et al . 2019。与CRISPR-BEST是否高效DSB-free基本编辑。《美国国家科学院学报》上。https://doi.org/10.1073/pnas.1913493116。
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