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CRISPR的新相机是一个蜂窝数据记录器

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CRISPR基因编辑技术使一个名字作为一个基因的瑞士军刀。遗传学研究社区,似乎只有他们的想象力有限,创建CRISPR应用程序已经以极快的速度- DNA侦探工作,干细胞创建和拯救世界的供应巧克力只是一些任务CRISPR已经证明在最近几个月的能力。


其最新的技巧,根据Broad研究所的科学家们公布了麻省理工学院和哈佛大学和哈佛大学化学与化学生物学系,是成为一个手机黑盒录音机。


记录仪系统,被称为CAMERA1,可以追踪细胞内事件的顺序和时间。作者表明,系统可以记录刺激细胞的环境,如暴露于病毒和抗生素。这项技术的最终目标是使用录音机来实现更深入地理解复杂的细胞过程,如基因蛋白的表达。


灯光,摄像机,行动

该研究发表在科学,利用CRISPR Cas-9酶,一对基因剪刀切DNA在预先确定的点。剪刀,目的是通过一个简短的遗传物质称为指南RNA,是减少细菌细胞的DNA。这允许研究人员插入质粒DNA的小圈。这些质粒已被研究人员允许转基因Cas-9目标。


当Cas-9削减DNA,哺乳动物细胞通常有修复机制来解决,尽管有时创建过程中的错误(科学地利用)。在这项研究中,使用的细菌细胞修复机制意义目标质粒等没有退化。研究者的最后是确保宿主细胞遗传变异只会开始生产Cas-9如果特定抗生素。


添加抗生素时,检测到的细菌细胞,Cas-9生产。酶切的质粒开始对Cas-9敏感,同时保留其他质粒。目标质粒然后退化,这意味着作者简单地监控两种类型的质粒的相对水平,读出的抗生素浓度和持续时间增加意味着Cas-9质粒相对较少。


这个读数非常敏感。研究人员可以检测信号从微小的数量只是数以千万计的细胞。最后,作者开发了一种技术可以重置改变:non-altered质粒率,这意味着多个录音可以取自相同的细胞。

CRISPR缝纫剪刀

作者并没有就此止步。CAMERA2第二装置,利用另一个CRISPR方法更微妙地改变字母的DNA单基地,缝纫剪刀CAMERA1的粗糙的镰刀。这种方法,基本编辑,是由刘和他的团队在2016年。在这样一个时尚编辑DNA损害细胞的风险。为了避免这种情况,系统设置系统,基函数编辑器只会在一个特定的基因称为“安全港”的基因,一个试验场,没有细胞损伤的风险。


这个系统能够记录四刺激,刺激的确切顺序发生。第二个系统修改与哺乳动物细胞,通过完全绕过质粒的必要性和监控更改直接向细胞的基因组。


这是我的下一个技巧…

这是只有一个多个CRISPR录音系统最近提出,但刘翔的创新是需要一些细胞。事实上,这种方法的简单性和灵活性是非常广阔的领域,在这个宏伟的目标是让这些CRISPR记录系统工作在动物模型中,而不是在细胞系。这种分析将提供一个全新的水平的细节究竟继续在我们的细胞。在这一点上,CRISPR只是炫耀。



参考:唐,W。d . r . & Liu (2018)。在细菌和哺乳动物细胞可重写光盘的多事件模拟记录。科学。https://doi.org/10.1126/science.aap8992
满足作者
Ruairi J麦肯齐
Ruairi J麦肯齐
高级科学作家
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