定义白血病进展中的全基因组调控事件
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研究人员高级科学练习曲研究所和跨学科研究所法国的研究人员正在使用应用生物系统表达阵列系统在全基因组范围内了解参与急性早幼粒细胞白血病发展的基因调控事件。
系统表观基因组学组负责人Arndt Benecke博士解释说:“使用1700化学发光微阵列分析仪和TaqMan®基因表达测定,我们正在研究白血病患者的样本,以确定多维基因签名。”
“我们将这些研究与其他微阵列技术相结合,例如染色质免疫沉淀(ChIP)芯片,并使用不同的计算机算法将实验结果转化为概率图。”
“然后,我们将这些概率图叠加到基因组序列上,并使用协方差和相关系数开发分析这些数据的方法,以便对调控事件做出预测。”
“我们选择表达阵列系统主要是因为其广泛的基因覆盖和系统的高灵敏度也很重要。”
“对于大多数探针,都有已经优化过的TaqMan分析,这为我们在下游验证步骤中节省了大量时间。”
“最终,我们希望我们的方法能够同时确定多因素疾病的几种潜在药物靶点。这一点从来没有真正成功地建立起来,但这是我们正在努力的方向。”
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