数字微生物用于模拟治疗反应

高威大学的研究人员与APC微生物爱尔兰,一个世界领先的SFI研究中心,已经创建了一个资源超过7000数字微生物——使计算机模拟药物治疗工作,病人可能如何应对。资源是一个里程碑人类应对医疗科学理解,因为它提供了机会的计算机模拟和预测代谢个体之间的差异,包括疾病,如炎症性肠、帕金森病和结肠癌。

数据库——称为AGORA2——基于专业发展的数字称为AGORA1微生物的第一资源。AGORA2包含7203数字微生物,从科学出版物创建基于实验知识,尤其关注药物的代谢。

资源已由大学的一组科学家戈尔韦的分子系统生理学组,由APC微生物爱尔兰首席研究员伊内蒂埃尔教授。

团队的研究旨在推进精密医学利用计算模型。

蒂埃尔教授解释说:“AGORA2向个性化的一个里程碑,预测分析的计算机模拟使person-microbiome-drug精密医学应用程序交互。

“人类是举办各种各样的微生物。就像我们一样,这些微生物吃和互动与他们的环境。考虑到我们都是独一无二的,我们每个人都举办一个微生物的新陈代谢也将个体之间的不同。

“数字微生物的数据库提供的见解提出了医疗机会利用代谢的个体差异提供个性化,提高精密医学的治疗,而目前更一般的“一刀切”的方法。

“除了我们的食物,我们个人也微生物代谢药物。相同的药物可能会因此表现不同的影响在不同的人因为不同的新陈代谢所执行的不同微生物。”

使用数字AGORA2微生物资源,计算机模拟表明,药物代谢变化明显个人之间,是由自己的微生物。

独特,AGORA2-based计算机模拟使微生物的鉴定和代谢过程对个人药物与临床观察。

今天的研究结果发表在《自然生物技术》。

高威大学的研究小组证明AGORA2使个性化,strain-resolved造型的肠道微生物的药物转化潜力预测从616年结直肠癌患者和控制,大大不同个体之间和与年龄,性别,体重指数和疾病的阶段。这意味着团队可以创建数字表征和预测特定于不同的微生物。

蒂埃尔教授补充道:“知识的个人微生物及其药物新陈代谢能力代表了一个精密医学机会调整药物治疗个体健康效益最大化,同时尽量减少副作用。

“利用AGORA2计算机模拟我们的团队表明,由此产生的代谢预测启用性能优越而什么是可能的。”

主任保罗•罗斯教授APC微生物爱尔兰说,:“这项研究是一个完美的图解计算方法的力量来增强我们对微生物的作用的理解明显在健康和疾病——这个数字平台将是一个很棒的资源可能导致小说的发展个性化的治疗方法,考虑到微生物。”

参考:喜力啤酒,赫特尔J, Acharya G,等。公司的7302个人类微生物代谢重建个性化医疗。生物科技Nat》。2023:1-12。doi:10.1038 / s41587 - 022 - 01628 - 0

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