人类基因表达的EMBL-EBI研究当前全球地图

就像一个管弦乐队的成员活跃在不同的时间虽然玩音乐的,在我们的身体每一个细胞都包含相同的基因序列,但表示这不同引起细胞和组织与专业属性。

通过整合从前所未有的各种人体组织的基因表达数据样本,艾尔维Brazma和他的团队在欧洲生物信息学研究所的边防哨欧洲分子生物学实验室(EMBL),和他们的合作者首次生产全球地图基因表达。这背后的全面分析决定我们的外表,独特的基因活动功能和行为是今天发表在《自然生物技术》。

分析使用的数据收集从163年全球实验室涉及5372年人类样本各种组织、细胞类型和疾病。大多数转录组实验比较基因表达在只有少数细胞类型或条件,虽然在技术上具有挑战性,整合这些数据在一个大规模的科学家创造了一种新的方式来探索基因表达。分析可视化的地图把人类基因表达的空间分割成六个不同的主要组或“大陆”。

大陆出现通过分组样本具有相似基因表达特征。这六组的身份成立:大脑;肌肉;造血(血液相关);健康和固体肿瘤组织;细胞系来源于固体组织;和部分分化细胞。通过在3 d可视化这些子集,比较的相似程度,可以在每个分组的基因表达谱。