使南加州大学表观基因组中心跟上不断变化的新一代测序技术和不断上升的吞吐量

南加州大学建立了全国第一个专门的表观基因组中心2007年7月,进行高通量表观基因组学和杠杆。南加州大学表观基因组中心进行全基因组表观遗传分析和技术开发的尖端外遗传性和以人群为基础的基因组研究。

中心最近获得资金参与癌症基因组图谱(TCGA)财团收集外遗传性数据来自所有主要的人类癌症在接下来的五年,约翰霍普金斯大学与史蒂夫Baylin博士合作。

像其他许多下一代测序实验室、表观基因组中心正在努力跟上不断发展的协议和更新Illumina公司管道的分析软件,已导致生成的测序数据增长了15倍自中心进入下一代测序。生物信息学的意识到,在收到第一个基因组分析仪,他们需要一个集中的数据和实验室管理信息系统。

这案例研究细节Genologics使南加州大学表观基因组中心如何跟上下一代测序和增加吞吐量。