表观遗传分析胃癌发现新的疾病亚型

发表在2012年10月17日出版的《科学转化医学》杂志上,研究结果是基于科学的表观遗传学,基因活性的研究。洞察胃癌的复杂性可以带来更好的治疗方法对世界上第二大癌症杀手,背后的肺癌。

“胃癌是一种异质性疾病与单个病人常常显示明显不同的反应相同的治疗,”帕特里克Tan说,医学博士在Duke-NUS博士,该研究的第一作者。“改善胃癌患者临床结果需要分子方法能够细分成生物相似的子组,并为每组设计subtype-specific疗法。”

像许多癌症,胃癌是由基因突变引起的,但也受到外部因素影响基因的工作方式。这些因素,称为表观遗传改变,通过甲基化,一个化学过程中沿着DNA特定位置,称为CpG网站,通过添加一个甲基被修改。甲基化沉默基因的行为不改变DNA序列。

在他们的研究中,谭和他的同事们使用了240主要肿瘤细胞系进行DNA甲基化的第一个完整调查景观在胃癌,称为methylome。他们的目标是确定新的胃癌的分子子组不是由主基因突变引起的,尤其是那些可能有针对性的治疗。

研究人员发现,胃癌methylome广泛,有超过一半的中央人民政府网站分析证明癌症的甲基化模式发生改变。甲基化改变的许多相关的重要基因表达的变化,这表明甲基化改变可能在胃癌的发展功能重要。

研究人员还发现了一个小组的胃癌症甲基化水平极高的。CIMP子群(CpG岛Methylator表型)之前提出,但其临床意义尚不清楚。Duke-NUS-led团队证实了CIMP子群,关联与年轻患者预后较差。他们还展示了在实验室的实验中,这些肿瘤可能脱甲基药物敏感性增加。

“我们的研究提供了清晰明确地展示这群的存在及其特性,”Tan说。“更重要的是,我们被鼓励,可能有潜在的实用测试CIMP肿瘤的敏感性更强的DNA可能脱甲基代理和其他表观遗传药物。”

研究还发现表观遗传沉默远程地区,一些针对广义地区和其他针对单个基因。这一发现可能有助于确定新的基因甲基化事件在肿瘤生长中发挥作用的地方。

“我们的研究结果有力地表明,胃癌不是一种疾病,而是一个集团的多种疾病,每一个都有不同的基础生物学和标志特征,”Tan说。“如果胃癌是多个因素互动的结果,包括环境因素和宿主遗传因素,我们需要更好的诊断和治疗方法。

“这些发现使我们向前,额外的工作将重点发展简单的诊断测试检测在早期胃癌,加上药物和药物靶点可能表现出高效能对不同疾病的分子亚型,”Tan说。

除了谭,研究的作者包括Hermioni Zouridis;Niantao邓;塔蒂阿娜伊万诺娃;马岩松朱;柏妮丝黄;丹黄;勇回族吴;爱丽丝应Ting吴;伊恩•Beehuat棕褐色;纳塔莉亚Liem; Veena Gopalakrishnan; Qin Luo; Jeanie Wu; Minghui Lee; Wei Peng Yong; Liang Kee Goh; Bin Tean Teh; and Steve Rozen.

本研究在一定程度上是由新加坡国家研究基金会支持下TCR旗舰胃癌财团和由新加坡卫生部国家医学研究委员会。