表观遗传指纹提供原产地证明鸡肉、虾和鲑鱼

自由放养的有机鸡肉或是工厂化养殖?德国癌症研究中心的科学家们(DKFZ)已经开发出一种新的检测方法,可以揭示这种差异在饲养。所谓的表观遗传方法基于特征模式的分析化学标记基因的动物。

鲑鱼与朋友吃晚餐真的抓住了野生还是来自水产养殖?什么做的所谓的“biolabel质量”的虾海鲜沙拉?和周日烤的鸡真的可以在户外度过其生命吗?

食品分析实验室只能回答这些问题在一定程度上。他们通常需要耗时的测试,结合几种不同的化验。DKFZ弗兰克Lyko领导的研究小组,从化学公司赢创和同事一起,可能现在呈现一个简单的解决方案。他们的新方法:分析化学的特征指纹标记在动物的基因组。

“食物的起源的问题正日益成为一个购买的理由时,消费者所受的影响尤为动物产品,因此还合计他幸福的动物,“Lyko说。“我们已经建立了一个令人惊讶的是敏感的检测方法,地图的许多环境因素相关的动物福祉。”

我们的遗传物质,DNA,是镶嵌在数以百万计的化学标记。这些所谓的甲基执行重要的生物功能。他们决定哪些基因翻译成蛋白质。

与终身稳定序列的DNA构建块,甲基标签可以再次跌落或删除。这种情况发生在适应生物需求。在人类,例如甲基模式,所谓“methylome”,病程和年龄的变化。这些可逆控制元素的全部基因组被称为表观遗传学。

环境因素的影响在methylome并不总是很容易证明。DKFZ弗兰克Lyko的实验室找到了一个理想的模式生物的大理石龙虾收集综合专业知识这个问题:“所有大理石龙虾都有一个相同的基因组,这意味着他们是一个克隆。因此,研究环境因素诱发的甲基化模式的改变不是由偏离伪造遗传因素,”生物学家Lyko解释道。

methylome分析,研究人员使用一种特殊的DNA测序技术,使他们能够识别每个DNA甲基化的构建块。Lyko因此和他的同事们能够明确地识别大理石龙虾人口来自世界不同地区的。他们能够区分动物和清洗或水域富营养化或从实验室饲养。研究人员也成功地跟踪的时间进程之间的甲基化模式切换时适应两种类型的农业。

鼓励这些明确的结果,团队成功地延长了methylome分析动物是人类饮食的一部分。他们开展了这个项目在赢创与同事合作。

研究人员能够区分不同饲养设施虾。鲑鱼的methylome缓慢流动的河流不同于他们的同种个体,住在山间溪流。在鸡、农场和饲料供给影响甲基化的模式。“环境和生活条件离开特定指纹methylome所有生物的研究。这个结果是不同的比在工厂农场自由放养的鸡,”Frank Lyko说。

“甲基指纹可以扩大食品分析作为一种重要的生物标志物的可能性,“说DKFZ研究员新浪穷尽的,该研究的作者之一。“然而,我们应用测序在这项研究是一个艰苦的过程,不能经常在食品分析中执行。因此我们与赢创合作开发methylome指纹识别的测试系统,还可以找到进入实验室在广泛的范围内。”

参考:马纳尔G,穷尽的年代,汉娜K, et al .上下文相关的DNA甲基化签名在动物家畜。环境Epigenet。2023;9 (1):dvad001。doi:10.1093 /燃灯/ dvad001

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