联邦芯片质量控制研究地址Intercompatibility微阵列基因表达的平台

FDA-led芯片质量控制(MAQC)项目的研究结果表明,微阵列基因表达数据的商业平台测试研究显示高程度的相关性。

结果,发表的自然生物技术》杂志上表明,科学家有能力选择基因表达平台基于内容的质量和价值,没有遗留数据的担忧。

MAQC项目比较多个全基因组基因表达谱在各种商业平台。

显示有一个相对高水平的协议所有平台之间和谐与逆转录PCR技术,一个单独的基因差异表达技术测量,证实微阵列数据直接对比,准确和生物学意义重大。

“MAQC项目跨测试站点观察intraplatform再现性以及高interplatform一致性的识别为差异表达的基因,”登月舱Shi说,MAQC项目主管美国食品和药物管理局国家毒理学研究中心。

“一个主要的结果是平台通常用不同方法生成类似的基因差异表达的结果。”

“换句话说,生物学的差异基因表达模式生成的是反光无论技术平台的差异。”

“鉴于这样高水平的一致性,选择基因表达平台主要应由成本等因素,易于使用和质量的内容,”肖恩·贝克说,Illumina公司基因表达的科学产品经理。

“Illumina公司BeadChips,证明始终成为最好的表演者在各种技术测量评估MAQC,贵也大大低于所有其他商业全基因组阵列用于这项研究。”

“数组和试剂成本不到一半的其他商业数组,使用Illumina公司BeadChips允许实验设计扩大,产生更强大的和farther-reaching结果相同的研究预算。”

MAQC结果为微阵列研究人员解决遗留数据的问题。

直到现在,研究人员已经犹豫地使用最新的微阵列基因表达技术由于担忧不一致的数据比较新发现对研究源自旧的或不同的微阵列技术。

类似的结果已经验证在其他地方。Illumina公司正在与行业领导者开发工具,以促进迁移遗留数据的基因表达的平台。