首次全面调查中发现的病毒DNA癌细胞
东安格利亚大学的研究人员已经开展的第一次全面调查发现的病毒在不同类型的癌症。
一个国际研究小组系统地调查了DNA中超过2600名患者的肿瘤样本38个不同类型的癌症。他们发现病毒的痕迹在13%的样本研究,并进一步确定了一些用来触发机制,病毒致癌突变。
发现在东安格利亚大学的科学家们开创了一种新的方式来发现与癌症相关的细菌和病毒。
丹尼尔•布鲁尔博士从东安格利亚大学的诺维奇医学院客座工人厄理工学院(EI)表示:“我们已经知道一些感染和癌症之间有着紧密的联系。例如,幽门螺杆菌的存在在消化道可导致胃溃疡和胃癌。与此同时,某些类型的HPV病毒可以导致宫颈癌。
“人体组织是越来越多的全基因组测序,我们进入一个基因组医学的时代。
“当肿瘤样本全基因组测序、DNA从任何病原体也测序,从而能够检测和量化的病毒。这给了我们一个绝佳的机会来收集数据来发现新的病毒之间的联系和不同类型的癌症。
“这是第一次系统的研究大多数癌症的病毒。它是很重要的,因为寻找新的感染和癌症之间的联系有潜力提供疫苗,如HPV疫苗,这样就可以减少癌症的全球影响。”
迄今为止,11病原体被确定为致癌——包括幽门螺杆菌某些类型的HPV病毒,Hepatits B, Hepatits C和巴尔病毒。在世界范围内,每年总共640000癌症是由人类乳头状瘤病毒(HPV),仅用疫苗预防宫颈癌的绝大多数。
这项新的研究概述的癌症病毒起作用。
研究人员还寻找以前没有与致癌相关基因的病毒,甚至是完全未知的。马克从DKFZ Zapatka博士说:“这病毒与癌症有关的问题在医学高度相关,因为在病毒相关癌症,真正的预防是可能的。
“如果确定致癌病毒,有可能避免感染预防癌症的疫苗开发。”
这项研究是由德国癌症研究中心(DKFZ),是整个基因组的Pan-Cancer分析的一部分(PCAWG),有1300多名研究人员组成的一个财团联手建立基因突变或模式的DNA突变在几种类型的肿瘤中发挥作用。这是一个倡议发起的国际癌症基因组协会(ICGC)。
荟萃分析,他们进行了一个全面的生物信息学分析超过2600肿瘤基因组的测序数据来自38个不同类型的癌症。
23个不同的研究小组发现了微量的病毒类型356年癌症患者。预计,已知的肿瘤病毒司机启动和成长是最常见的。
eb病毒(EBV)的基因组,这导致许多不同类型的癌症(特别是淋巴瘤,胃癌和鼻咽癌),被发现在5.5%的癌症基因组研究。乙型肝炎病毒(HBV) DNA被发现于62年的330例肝癌。
研究小组发现人类乳头状瘤病毒,通常HPV16, 19 20宫颈癌病例和18个57头部和颈部肿瘤。
布鲁尔博士说:“我们发现,人类乳头瘤病毒的存在是互斥的一些重要变化出现在头部和颈部癌症,这意味着HPV病毒可以帮助癌症发展没有额外的变化其基因组。”
该小组还排除了一些病毒之间的连接,包括腺病毒和摘要杆状,和癌症。
在一些情况下,研究小组发现其他病毒已经导致癌症,如肾脏癌的逆转录病毒。其他病原体偶尔发现肿瘤的组织类型,他们通常感染,如巨细胞病毒在胃癌。
在一些肿瘤与人乳头状瘤病毒和EBV,研究人员观察到,驱动突变特征,这些癌症的细胞增长通常取决于人失踪。病毒的存在可能通过其他因素支持恶性肿瘤细胞变性。
病毒整合到宿主基因组被发现是最重要的机制,导致突变由病毒引起,裕宝银行尤其是和乳头状瘤病毒。
布鲁尔博士说:“我们还发现,病毒在肿瘤的存在与变化的模式与故障相关的基因组DNA损伤修复机制在人类细胞。这表明受损的抗病毒防御的角色作为颈驱动力,膀胱和头颈部癌。”
德国癌症研究中心教授彼得·里胥特博士(DKFZ)说:“当整个癌症基因组分析,我们发现病毒的痕迹在相当多的肿瘤比早期的研究,是基于调查RNA。不过,我们无法确认共同的猜测,还未知病毒与癌症有关。
“然而,在许多情况下,我们现在有一个更清晰的了解病原体导致细胞恶性突变。”
大卫从鲍勃冠军癌症Dearnaley信任教授说:“这是一个强大的国际协作企业编目人类癌症的病毒协会。
“深度从超过2600个癌症全基因组测序和配对正常组织使用健壮的方法,以避免“假发现”显示大约16%的癌症病毒相关,高于先前估计。
“已知关联的一系列病毒例如子宫颈,头部和颈部,肝脏和胃癌症已确认但公认的对脑瘤驳斥了。
“协会的研究人员探索机械的解释显示例如病毒集成可能驱动较高的端粒酶表达肿瘤发生的和强调潜在的病毒整合的重要性的免疫反应。
“小说病毒隔离“点击率”少见。结果给重要的新见解肿瘤分类和发展的未来前景小说癌症靶向策略。”
参考
Zapatka等。(2020)病毒协会的景观在人类癌症。自然遗传学。DOI: https://doi.org/10.1038/s41588 - 019 - 0558 - 9
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