由于主要格兰特,科学家们确定癌症蛋白质标记

湾区科学家领导的研究小组的五个全国主要拨款国家癌症研究所(NCI)提炼和规范技术识别血液中的生物标志物——特定的蛋白质,和他们作出的模式,为癌症的早期检测。

赠款,信号NCI的战略转向研究针对癌症的早期检测,旨在导致许多这样的生物标志物的发现,科学家们说。

下的拨款已经发行NCI癌症临床蛋白质组学技术评估项目五年临床蛋白质组学技术倡议的一部分,癌症。

团队是由苏珊Fisher博士,加州大学旧金山分校细胞和组织生物学教授,加州大学旧金山分校生物分子资源中心主任质谱设备,的一员加州大学综合癌症中心和一个来访的科学家伯克利实验室生命科学部门。

首席调查人员乔·w·格雷博士生活和环境科学实验室主任助理在美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室,加州大学旧金山分校的教授实验室医学、乳房肿瘤,也是旧金山加利福尼亚大学综合癌症中心的项目,和布拉德福德•吉布森(george w . bush),化学博士、教授和主任巴克年龄研究所加州大学旧金山分校的副教授和药物化学。

团队还包括关键的研究加州太平洋医疗中心在旧金山,安德森癌症中心在休斯顿,英属哥伦比亚大学在温哥华。

团队将建立最好的方法的上下文中进行质谱分析癌症生物标志物的发现。

关键的第二步将涉及合并数据和分析,将碎片拼凑的目标蛋白质识别的识别分子,研究和识别模式的蛋白质在给定的血液样本。

需要规范质谱是伟大的。目前,在不同的实验室技术产生不同的结果。

研究在一个实验室可能暗示某些蛋白质与给定的血液样本,当另一个实验室的研究指向其他蛋白质。

检测体液中蛋白质的能力是一件令人感兴趣的癌症研究人员因为癌变肿瘤“泄漏”蛋白质和其他分子进入血液,尿液和其他体液在其发展的早期访问。

这些知识已经被应用在诊所:前列腺特异性抗原(PSA)水平升高提示前列腺癌的存在,而高浓度的癌抗原125 (ca - 125)建议可能的卵巢癌症或其他器官。

然而,测试“假阴性”或“假阳性”,使他们不可靠。

如果质谱可以细化和标准化,科学家说,它可以彻底改变癌症的检测,导致早期干预与当前治疗——手术、放疗、化疗和靶向药物治疗。

这种技术也可以用来监测癌症治疗的反应和检测癌症治疗后的复发。

“这是一个非常激动人心的努力,”费舍尔说。“我们相信在这个项目中,它会帮助人们。我们认为,我们提出的方法会工作。”

加州大学旧金山分校的组成部分这一研究计划将在两个阶段进行。

最初,科学家将研究老鼠的血液样本,与人类乳腺癌细胞移植。

之后,他们将研究的不同阶段患者的血液样本实际的疾病。

研究人员将特别关注蛋白质发展阶段被称为“转录后修饰,”发生后的代码一个基因已被翻译成蛋白质。最初,蛋白质是一个“裸支架,”费舍尔说,但是随着时间的推移变得装饰,就像一棵圣诞树。这是舞台上的“修改”。

费舍尔说,众所周知,癌症细胞修饰蛋白质非常草率。“我们想要使用这些知识与癌症细胞,”她说。“努力净化这些糟糕的装饰蛋白质,这样我们可以识别作为生物标志物在血液样本。”

分析复杂的数据由质谱使用先进的计算技术——科学被称为生物信息学将理解的关键信息,费舍尔说。

部分挑战是需要拼凑数据个别蛋白质的碎片,而不是整个分子的质谱分析的局限性:

仪器是无法衡量一个完整的蛋白质。蛋白质首先必须降低,酶,成碎片。

一旦足够的难题是输入到数据库中,预计将会出现。

结果可能是识别与早期乳腺癌相关的生物标志物。

五年UCSF-led赠款资助的大约每年100万美元。

仪器的启动资金,使购买通过桑德勒家庭基金会的资助。