基因生物标志物可以预测COVID-19严重性

科学家们科罗拉多大学医学院和同事们UCHealth科罗拉多大学医院,发现特定的基因生物标记,不仅显示COVID-19感染,但提供洞察疾病的严重程度,填充一个主要诊断差距。

“我认为这项研究是一个巨大的概念在COVID-19领域测试,可以应用于其他疾病,”说,这项研究的第一作者,凯瑟琳·巴恩斯,铜医学院的博士,教授。“这是一个精密的世界医学的主要前进。”

这项研究发表在周二的杂志通信医学表明,特定的信号从一个过程被称为DNA甲基化变化感染者和未感染SARS-CoV-2之间。他们可以表明疾病的严重程度甚至在早期阶段。

细胞如何的关键功能,DNA甲基化是表观遗传信号工具细胞用来关闭基因。任何错误在这个过程中会引发多种疾病。

巴恩斯认为需要关注这些信号可以帮助填补差距在当前的世界COVID测试。大多数COVID-19抗原或快速测试依赖于病毒株,可以携带高的假阴性率。他们不预测如果病毒是可行的和复制,也不预测临床结果,这项研究说。

pre-symptomatic病人可能测试为阴性SARS-CoV-2病毒而恢复仍阳性病人尽管不再具有传染性。

“迫切需要准确诊断控制持续的公共传播,为了更好地理解宿主反应,开发疫苗和抗病毒药物,”这项研究说。“识别SARS-CoV-2感染患者最有可能出现严重的疾病通过增强将使临床医生诊断病人的临床决策支持”。

但作者说,他们不知道任何测试可以预测COVID-19的临床过程。

考虑到这一点,他们分析了表观基因组的患者的血液样本,没有COVID-19。他们从Illumina公司定制的工具称为英飞纳姆甲基化史诗数组来增强免疫反应检测。研究人员然后异形外周血样本164 COVID-19病人和296个对照组。

外围血收集DNA样本从病人看到UCHealth和检测SARS-CoV-2表观遗传签名从3月1日开始,2020年。大多数血液标本被收集在科罗拉多大学急诊医学样本银行的指导下研究的合著者安德鲁•蒙特医学博士,博士,传递到科罗拉多州美国安舒茨研究遗传学组织(货物)。额外的标本取自病人同意科罗拉多大学COVID-19 Biorepository。

研究人员发现特定的基因标记SARS-CoV-2感染和疾病的严重程度的迹象。

“这些疾病进展的信号存在从最初的抽血当第一次走进医院,”这项研究说。”在一起,这些方法演示测量表观基因组的潜在监测SARS-CoV-2状态和严重程度”。

巴恩斯表示,这项发现可能最终导致新的COVID-19和更精确的方法来测试。

“我们正在探索这个平台如何增加COVID诊断价值的世界,”她说。“我们认为它增加了了解患者出现更严重的疾病。这可以告诉你如果你能安然度过感染或如果它有可能变得更糟。”

参考:哥尼斯堡IR,巴恩斯B,尹浩然,坎贝尔。主机甲基化预测SARS-CoV-2感染和临床结果。Commun地中海。2021;1 (1):1 - 10。doi:10.1038 / s43856 - 021 - 00042 - y

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