基因“开/关”开关可能导致结直肠癌亚型

新的研究在结肠直肠癌由调查人员约翰·霍普金斯Kimmel癌症中心表明,转录因子的表达,蛋白质,帮助打开或关闭特定基因通过绑定到附近的DNA——可能发挥核心作用在整个基因组DNA甲基化的程度,导致不同亚型的这些癌症的发展。

甲基化过程中,某些化学组连接到区域DNA指导基因的开/关开关。研究这些转录因子的表达在结肠直肠癌患者可以揭示生物标志物,以帮助确定总体存活率在结肠直肠癌的子群的人通常有更好的存活率和,重要的是,更好的应对免疫检查点疗法——一种免疫疗法,释放限制肿瘤细胞在免疫反应——和其他治疗方法。可以看到相似的转录因子表达的研究人员甚至在癌前息肉,并可能被医生用来确定哪些患者需要密切随访,防止癌症的发展。

一个描述的工作是7月24日在线发表在《华尔街日报》美国国家科学院院刊》上。

异常的DNA甲基化是一个众所周知的现象发生在癌症、高级研究作者解释道Hariharan终极博士,理学。,肿瘤学副教授约翰霍普金斯Kimmel癌症中心,但在癌症的DNA甲基化程度不同的组织类型。一些结肠和其他癌症DNA甲基化程度非常高收益而其他DNA甲基化所得的频率要低的多,他说。传统上,这些都是描述一个区域的基因组被称为启动子区域,这有助于启动转录过程。这些变化的确切机制尚未明确。

在一系列的实验室研究的遗传物质从管状腺瘤(癌前息肉在结肠)和结肠肿瘤,研究人员与癌症特异性转录因子表达变化在结肠直肠癌及其癌变前的甲基化改变前体病变,提供见解的起源和演化不同分子亚型的结肠直肠癌。

具体地说,研究人员观察到基因组的某些区域发生甲基化倾向于增加对转录因子结合位点表达下调,或低表达。在某些类型的结肠癌,基于类型的与癌症相关的基因改变,转录因子是调节或有更高的表达式。

研究结果表明,癌症特异性甲基化差异可能由于扰动发展的活动或转录因子的表达。类似的DNA甲基化模式的变化观察癌前息肉。

“这些研究强调,转录因子的表达变化和相应的DNA甲基化变化是早期事件在肿瘤的发展过程中,“主要研究作者的腐竹班达里说,博士,研究员约翰·霍普金斯Kimmel癌症中心。“息肉不携带所有的关键基因变化通常发现在成熟的癌细胞,转录因子的变化可能代表最早的癌前细胞分子的监管机构,对全基因组DNA甲基化的变化和深远的影响。”

特定的转录因子识别的研究可能有助于在分层结直肠癌预后,终极补充道。

“这是特别重要的,因为多个研究表明,某些亚型的结肠直肠癌最好的免疫响应检查点封锁疗法,而其他人可能不会如此成功,”他说。“相关转录因子的表达分析可以帮助开发更好的治疗策略在结肠直肠癌的亚型。”

参考:班达里年,克里希纳V,权力R, et al .转录因子表达曲目表观基因和转录亚型的结肠直肠癌的基础。PNAS。2023;120 (31):e2301536120。doi:10.1073 / pnas.2301536120

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