新加坡基因组研究所和罗氏罗氏:跟踪H1N1甲型流感的进化路径

最近爆发的流感病毒,甲型流感(nH1N1)的新菌株,迅速传播到世界各地。许多专家都担心这个新菌株的进化轨迹,以及它是否会与其他流感病毒变异或re-assort可能产生一个更致命的毒株,世界经历了1918株。

识别这些突变和重组,一个团队的新加坡基因组研究所已经开发了一个新的“通用的”聚合酶链反应(PCR)方法,可以放大任何甲型流感病毒的全基因组;紧随其后的是罗氏芯片杂交测序,允许快速扭转整个在大约24小时。

这种新方法可以使用相同的RNA材料遗留下来的传统的基于PCR诊断方法和可以识别任何小说在第一遍流感病毒。这将使更快的发展,诊断为任何可能的新变体;它还可以确定菌株的DNA改变变得更加危险。

与罗氏罗氏的科学家们密切合作,利用罗氏平台提供了灵活性,第一个阵列设计,制造,运往新加坡项目开始后4天。定制开发的高密度芯片包含探测器可以揭示完整的从患者样本序列的流感病毒。这将使任何一个基地突变的检测区域的基因组,这是重要的药物敏感性。病毒发生重组,这将是能够识别这流感病毒结合,以及基因重组的位置,以更好地了解和跟踪进化路径和变异的病毒。

Christopher Wong博士生物标记发展GIS首席科学官说:“这种新方法利用我们的小说PCR技术,开发了用于检测多种病原体。这将大大简化新病毒测序的过程。”

罗氏罗氏的CEO, Gerd马斯河博士说:“这个新系统的发展,整个项目团队希望能更好、更快地跟踪这种新型流感变异和让世界了解病毒是如何发展的。”

GIS执行董事爱迪生刘教授补充道,“这跟踪过程可以更好的欣赏的意义,因为它提供了重要信息,可以用来预防或应对大流行。”

使用类似的方法使用罗氏阵列成功2003年非典爆发期间了解感染源和全球监测SARS病毒。