导致脑膜炎的细菌基因组被发现
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的耶鲁大学研究人员的团队使用454生命科学公司的基因组测序仪FLX揭示了鲍曼不动杆菌(a.b ummannii)基因组的高致病性含量。这种细菌会引起各种感染,包括肺炎、脑膜炎和尿路感染。
它通过裸露的伤口进入身体,捕食弱者和病人,例如,在伊拉克的受伤士兵中就有许多这种感染的报道。虽然定植对健康的人没有威胁,但这种细菌会导致严重的临床疾病,并与高死亡率有关。
据耶鲁大学分子、细胞和发育生物学学系的迈克尔·斯奈德博士说:“这种生物的基因组序列对于了解它如何伤害人类至关重要,最终将有助于设计对抗这种传染病的治疗剂。”
这项研究结合了DNA测序和利用转座子诱变的功能筛选,探索了这种细菌的基因组。转座子诱变是将一段DNA从基因组的一个部分“剪切粘贴”到另一个部分,从而导致基因的破坏,使研究人员能够找到致病或引起耐药性的基因序列。
在这个过程中,转座酶在连接到目标位点之前在DNA中进行交错切割。然后,DNA聚合酶在DNA连接酶关闭糖-磷酸主干之前填补空白。
细菌中的转座子通常携带除转座子以外的其他目的的基因,通常用于抗生素耐药性。这些转座子可以从染色体DNA跳到质粒DNA,然后返回,允许转移和添加编码细菌耐药性的基因。
这项新研究将很快发表在《基因与发育》杂志上,题为《高密度焦磷酸测序和转座子突变揭示鲍曼不动杆菌发病机制的新见解》。
454的研发副总裁Michael Egholm博士说:“我们相信,454测序可以快速阐明任何微生物的DNA序列,当与基因功能筛选相结合时,可以识别出许多对微生物发病机制重要的新基因。”
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