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GenomeQuest和SGI宣布全基因组分析架构


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GenomeQuest和SGI宣布世界上第一个全基因组分析的直接可用性(WGA)服务人员。因此,制药公司,核心实验室,生物技术,政府机构,和诊所现在直接访问全基因组处理以前只发现在基因组中心结合全面、自助分析。

美国作家协会服务允许全基因组外显子组研究团队:

•存储、管理和比较序列和注释
•从任何仪器组装和序列对齐
•交互式查询和分析其运行和项目
•合并和re-analyze发现从同事和公共研究
•使用标准的工作流程,包括变异检测,RNA-Seq, ChIP-Seq
•构建和查询档案、企业范围的变体
•与其他工具/系统集成通过各级API

“数据分析被公认为全基因组研究的瓶颈。传统上,研究人员获得静态报告他们的顺序运行,在卷,无法分析和越来越孤立,”雅克Codani GenomeQuest首席科学官说。“从一开始,《GQ》引擎为研究人员提供了丰富的、交互式报告和集成的能力和re-analyze与其他工作。现在,随着SGI在高性能计算的长期经验,我们已经找到最适合我们的箭的弓WGA的服务。”

GenomeQuest和SGI联合开发软件和硬件架构优化下一代测序,使全基因组规模和性能。基于这种架构,WGA的服务可以通过升级GenomeQuest数据中心或直接部署到客户的数据中心,可能需要的大账户,核心实验室,诊所。

“很明显,编剧是巨大的存储和计算需求和独特的,“Eng Lim吴作栋博士说,在SGI高级副总裁兼首席技术官。“考虑到算法的复杂性和数据的规模,在这个领域的成功需要仔细考虑优化整个系统的四个关键部分——软件,计算和I / O能力,和burstability。我们非常兴奋的新GenomeQuest中心,并应用这使生命科学组织的蓝图”。

GenomeQuest中心升级5月18日,2010年。重大投资,它从根本上改善了用户体验和性能对现有商业和学术用户超过2000。

“我们已经观察到一个激进的改变使用GenomeQuest新中心的开幕以来,“评论Ron Ranauro GenomeQuest CEO。“我们的个性化医学研究应用程序处理每月成千上万的外显和将很快扩展到超过1000人基因组在deep-coverage。”
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