GenomeQuest™帮助加州大学戴维斯分校的研究人员发现一种新病毒从葡萄藤下降

GenomeQuest公司宣布加州大学的研究员戴维斯利用其最近宣布随需应变的信息解决方案来处理和分析新一代测序数据,成功地导致新的RNA病毒的识别从下降的西拉葡萄品种。

中的项目是由加州大学戴维斯分校的研究人员从阿迪博士Rowhani的实验室,Maher Al Rwahnih博士的监督下。研究人员追踪的组成和来源未知的病毒,被怀疑导致下降的疾病在加州西葡萄园。这工作支持的努力帮助葡萄园的葡萄酒行业管理和葡萄生产。

研究人员使用罗氏454平台生成大量数据文件代表健康和患病的植物遗传物质样本。的GenomeQuest™团队,让-雅克·Codani博士的监督下,适应生物信息学工作流来计算,从原始数据序列,通过分组和有价值的数据库分类序列已知的生物有很高的相似性。

没有匹配的序列分组以这样一种方式,帮助研究者找到相似性潜在隐藏已知病毒和病毒。

加州大学戴维斯分校的研究人员然后通过GenomeQuest能够访问数据库的web界面选择怀疑序列已知生物没有很高的相似之处,但与已知病毒——最终发现难以捉摸的匹配序列对这些病毒的罪魁祸首的专门的病毒数据库。

阿迪博士Rowhani加州大学戴维斯说,“这成功识别可疑生物是真正开创性的研究将加州葡萄酒行业的实际好处——这一事实是一个伟大的骄傲我们的基于加州大学戴维斯中心团队。”