肠道微生物可以帮助诊断肝脏疾病

非酒精性脂肪肝病(NAFLD)是一种可以导致肝硬化和肝癌——不是通常发现直到进展顺利。即使是这样,需要一个侵入性诊断肝脏活检。检测非酒精性脂肪肝和更容易早些时候,非酒精性脂肪肝研究中心的研究人员在加州大学圣地亚哥医学院人类长寿,inc .)和j·克雷格·文特尔研究所的报告,病人的粪便样本的独特的微生物组成——或肠道微生物——可以用来预测先进的非酒精性脂肪肝与88年94%的准确率。

概念验证研究中,涉及135名参与者,是5月2日发表在细胞的新陈代谢。

“我们估计,多达1亿名成人和儿童在美国可能有非酒精性脂肪肝。确定到底是谁或疾病的风险是一个重要的未满足的医疗需求,”医学博士说,Rohit Loomba第一作者的医学教授胃肠病学分部的,非酒精性脂肪肝研究中心的主任和教员在加州大学圣地亚哥分校的微生物创新中心。“大约有50个新管道非酒精性脂肪肝的药物,包括5可能会在未来两年内批准使用。如果我们能更好地诊断这个条件,我们将更好地进入正确的类型的患者在这些试验中,并最终将能更好地预防和治疗它。”

非酒精性脂肪肝的确切原因尚不清楚,但饮食和基因起到了实质性的作用。多达50%的肥胖人认为非酒精性脂肪肝。随着越来越多的证据表明,一个人的肠道微生物的组成可能会影响他或她的肥胖的风险,Loomba和团队开始怀疑肠道微生物也可能与肥胖相关的肝脏疾病。如果是这样,他们假设stool-based“读出”的生活在一个人的肠道可能提供洞察他或她的非酒精性脂肪肝的地位。

为了回答这些问题,Loomba和团队检查了两个不同的患者团体。第一组包括86例非酒精性脂肪肝患者,通过活检确诊。其中,72年轻/中度非酒精性脂肪肝和14有先进的疾病。合作者在人类长寿公司测序的微生物基因从每个参与者的粪便样本中提取和使用这些信息来确定哪些物种生活在那里,和各自的相对丰度。研究人员发现37个细菌物种杰出轻/中度非酒精性脂肪肝从先进的疾病,使他们能够预测哪些病人患有晚期疾病的准确率为93.6%。

团队验证这一发现第二个学习小组,包括16个先进的非酒精性脂肪肝患者和33名健康人作为控制。在这种情况下,他们发现9个细菌物种的相对数量允许他们区分非酒精性脂肪肝患者和健康志愿者,准确率达到了88%。7这些细菌种类重叠在前面使用的签名37组。

有四个主要类型的细菌中发现的人类肠道:厚壁菌门,变形菌门、拟杆菌、放线菌。Loomba和团队发现先进的非酒精性脂肪肝患者倾向于有更多的变形菌门和厚壁菌门的凳子少于那些早期非酒精性脂肪肝。在物种水平上,研究人员发现一个主要的区别是在大量的大肠杆菌——这些细菌共同先进的非酒精性脂肪肝患者的三倍大于早期患者。

“我们相信,我们的研究奠定了基础为潜在stool-based测试先进检测肝纤维化仅仅基于微生物模式,”资深作者凯伦·e·尼尔森说,博士,总裁j·克雷格·文特尔研究所的“或者至少帮助我们减少病人的数量进行肝脏活检。”

虽然Loomba估计stool-based微生物诊断可能花费1500美元在当今市场上,他预计,成本会降低,低于400美元在未来五年内由于基因组测序和分析技术的进步。

而兴奋,到目前为止,研究人员警告说,这种新的诊断方法只在一个相对较小的患者组被测试在一个单一的、高度专业化的医疗中心。这个团队现在正申请赠款资金扩大他们的研究在一个更大的群体在多个网站。即使成功,stool-based检测非酒精性脂肪肝不会用于病人至少5年,他们说。Loomba还指出,尽管不同的微生物物种可能与先进的非酒精性脂肪肝相关,这项研究没有表明,这些微生物会导致非酒精性脂肪肝的存在与否,反之亦然。

“我们期待进一步的研究来评估这个角色,如果有的话,这些微生物物种在肠道通透性,肝脏炎症和相声和其他因素诱发肝损伤,并最终影响在非酒精性脂肪肝疾病进展,”研究的合著者大卫·a·布伦纳说,医学博士,加州大学圣地亚哥分校副校长健康科学和加州大学圣地亚哥分校医学院的院长。

“了解微生物,就像人类基因组的测序是谜题的一部分对人类健康和疾病,”研究作者j·克雷格·文特尔说,博士,人类长寿,Inc .的创始人兼执行主席”新技术,如机器学习,考虑到巨大的进步来解释这些数据。”

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参考:

Loomba, R。Seguritan, V。李,W。长,T。Klitgord, N。Bhatt,。,。纳尔逊,k . e . (2017)。肠道Microbiome-Based宏基因组特征的非侵入性检测先进人类非酒精性脂肪肝病纤维化。细胞的新陈代谢,25 (5)。doi: 10.1016 / j.cmet.2017.04.001