Helicos发射与微生物基因组数据开放存取网站

Helicos生物科学公司宣布推出HeliSphere™技术中心,一个开放存取网站分享Helicos数据集和生物信息学软件工具。

第58届年度会议期间推出了美国社会的人类遗传学,开源网站展示了单分子序列读取从全基因组重测序和数字基因表达运行使用Helicos™遗传分析系统。

第一个样本数据集包括全基因组序列的公布微生物大肠杆菌,金黄色葡萄球菌,和Rhodobacter sphaeroides,测序共识精度大于99.995%。每个样本数据集,生成包含6到1200万一致读,从一个频道的50-channel运行在HeliScope™单分子测序仪。

“这些数据构成的第一个示范全基因组测序在单分子层,并强调独特的可伸缩性的好处,甚至覆盖和提供高精度Helicos真正的单分子测序(tsm)™技术,“Helicos首席执行官史蒂夫Lombardi解释道。

数据从许多激动人心的测序项目目前正在将张贴在HeliSphere™技术中心网站定期。

除了Helicos数据集,新网站也是一个网关Helicos的开源项目,包括可下载的源代码和软件文档和网站托管http://sourceforge.net/。

“开放存取网站福利客户和软件开发人员,以及更广泛的科学界不仅通过数据集,但源代码和支持工具方便,“Lombardi说。

该网站支持“tarball”下载的源代码和使用众所周知的共享访问工具,比如Wiki文档和邮差邮件列表。的Helicos™技术中心还将拥有一个开放的bug跟踪系统和娱乐从开发者提交的补丁。

源代码可以通过广泛使用自由软件许可证GPL许可(通用公共许可证)一般使用,通过合作伙伴的商业许可证。密码来访问这个开源Web站点可以合格的科学家。