俯瞰历史偏见COVID-19相关基因

基于全基因组实验,人体有2064个基因与COVID-19有关。为什么研究人员只研究其中611吗?

历史偏见——长期以来人类基因研究,决定现在是影响生物医学研究者研究COVID-19,根据最新的美国西北大学的研究。

虽然生物医学研究者知道很多被忽视的人类基因COVID-19扮演一个角色,他们目前不学习。相反,研究人员,研究COVID-19继续关注人类基因已经被大量研究独立于冠状病毒。

“可以理解的原因,研究人员往往建立在现有的知识和研究工具。他们似乎选择基因研究基于实验的缓解而不是他们的终极相关性疾病,”西北大学的托马斯·Stoeger说,共同研究。“这意味着COVID-19研究只集中在一小部分所涉及的人类基因的病毒。因此,人类细胞的反应的许多方面对COVID-19依然不理解。”

“有许多基因与COVID-19有关,但是我们不知道他们在做什么在COVID-19的背景下,“西北大学的路易斯·阿马拉尔补充说,该研究Stoeger。“我们没有研究这些基因在大流行之前,和COVID-19似乎并不是一个动机调查。”

该研究发表在《华尔街日报》eLife。

Stoeger是数据科学学者西北复杂系统研究所(尼克)和遗传医学中心。通过“独立通路”奖国家衰老研究所Stoeger是开始一个研究实验室,致力于揭示自然的基因衰老和衰老相关疾病的重要贡献。Amaral的以o .还在西北大学化学和生物工程教授麦考密克工程学院。Stoeger和阿马拉尔都是成员成功的肺炎治疗的临床反应(脚本)系统生物学中心。

确定一个历史偏见

本研究基于Stoeger和阿马拉尔2018年的研究,这是第一个解释为什么一些人类基因研究比其他人更受欢迎。在这工作,他们发现30%的基因没有被研究和不到20%的基因是超过90%的发表论文的主题。

尽管日益普及的新技术研究和描述的基因,研究人员继续研究一小群基因,科学家们研究了自1980年代以来。从历史上看,这些基因容易调查实验。如果一个动物模型也有类似的基因对人类,例如,研究人员更倾向于研究基因。西北团队还发现,博士后研究人员和博士学位的学生关注差特征基因降低50%的机会成为一个独立的研究人员。

虽然人类基因组计划——所有人类基因的识别和映射,完成于2003年,旨在扩大科学研究的范围超出了这个小的子集的基因,它还没有实现这一目标。

“偏见研究相同的人类基因非常高,”Amaral说。“整个系统是战斗的目的机构和科学知识,这是拓宽我们学习和理解的事情。我们需要共同努力激励其他基因的研究重要的对人类健康。”

偏见持续到COVID-era

在新的研究中,Stoeger Amaral转向LitCOVID, COVID-19研究出版物相关的集合,由国家医学图书馆策划。LitCOVID标记基因中提到的标题、摘要或结果的部分单独的出版物。

西北大学的研究人员分析了10395年发表的论文和预印的集合。然后,他们整合成一个自定义数据库超过100种不同的生物和文献数据库,以调查和测量生物医学研究的各个方面。最后,他们比较COVID-19-related COVID-19论文中提到的基因基因被四个全基因组的研究。

Stoeger Amaral也追踪基因出现在COVID-19文学的发生。令人惊讶的是,他们观察到COVID-19基因的研究越来越多但少不膨胀爆发以来的大流行。

其研究团队希望激发其他研究人员意识到过去的偏见和探索自然的基因。

“我们的研究结果有直接影响的长期规划科学决策者“Stoeger说。“我们可以研究指向人类基因对病毒细胞反应是重要的但是被忽视的风险由于历史上获得的偏见,这是文化增强。”

参考:Stoeger T, Nunes Amaral洛杉矶。COVID-19研究风险忽略重要的宿主基因由于预先设定的研究模式。罗杰斯P, V Danchev,郑H,棕色的年代,eds。eLife。2020;9:e61981。doi:10.7554 / eLife.61981。

本文从以下转载材料。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。