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人类家庭树映射的新细节由斯坦福基因测序工作


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斯坦福大学研究人员已经创造了迄今为止的人类遗传多样性最高分辨率的地图,提供世界各地了解群体和增加体重相关先前的理论,人类起源于非洲。

研究人员调查了650000个基因的位置从51人推导出地图,提供数据,将成为一个有价值的工具在寻找疾病相关基因。这项工作发表在2月22日的问题科学

马库斯·费尔德曼博士,生物科学教授,他花了几十年研究人类遗传多样性,随着Luca Cavalli-Sforza合著者,博士,遗传学名誉教授表示,扩大工作早在他们的许多想法。“这是权威研究显示种群内变异,”费尔德曼说。

数据组的人根据他们的相似性在650000 DNA的位置。在每一个位置,一个人有一个DNA的四个字母:a、T、C、G .所有那些在特定的位置有一个G将组合在一起,等等。尽管许多基因研究者多年来求这种广泛的基因测序工作,很少有实验室资源来解决它。

斯坦福集团是唯一适合的项目,因为斯坦福人类基因组中心的技术能力,也扮演了一个角色在人类基因组的测序。

“这些数据显示,所有的人类以复杂的方式有关,”合著者格里高利Barsh说,医学博士,博士的遗传学教授。“许多我们称之为人口真的混合物的人。”

数据还持有一些新的信息。在西伯利亚的一群人分享一些遗传相似性,通过推理,与南美土著的人血统。费尔德曼说,这一数据根据以往的理论意义来自西伯利亚的人类迁徙越过白令海峡大桥到美洲。

除了看到哪些组相关数据为研究人员追踪人类迁徙的能力。人类学家先前认为人类起源于非洲撒哈拉沙漠以南地区,在世界其他地区的几波。这个理论,称为“走出非洲”,得到了一些以前的遗传研究但不是普遍接受。

这个新的数据支持走出非洲模型,表明种群遗传多样性减少人口是来自非洲的更远。这个结果预计如果冒险的人们离开非洲只占整体的一小部分人口的多样性。这个小组将建立新的,更少的多样化人口在世界其他地方。

也许更重要的是比研究人员发现别人可以学习在未来的数据。研究人员让他们的数据公开就完成了分析。

尽管让竞争组织在他们自己的项目,资深作者理查德•迈尔斯博士的遗传学教授,说这是正确的做法。唯一的条件是,其他组允许斯坦福团队发表第一篇论文使用的数据,遵循先例的公共努力人类基因组序列。

“就像人类基因组计划,这将使人们重要的新事物了解人类历史和疾病,”迈尔斯说。作者华唐博士的遗传学助理教授,说,应该有助于推动工作人员向个性化治疗遗传疾病,如癌症。

将有用的数据是在一个地方寻找疾病相关基因,说Devin湾博士,斯坦福人类基因组中心的资深科学家的实验研究和分析。湾和李小君博士,资深科学家,co-first作者论文的。

当寻找致病基因,人员比较有和没有特定疾病的群体,并寻找遗传差异。其中的一些差异可能是由于受试者的遗传基因,而不是疾病本身。来自斯坦福大学的数据可以帮助研究人员确定哪些变异是由于遗传基因,帮助他们关注变化与疾病相关。

早期的研究数据也证实,绝大多数种群之间的遗传变异发生在人口而不是。“大部分的DNA变异我们看到无关的人通常使用“种族”这个词的意思是,”费尔德曼说。

这个工作的DNA来自人类基因组多样性面板中,一组由Cavalli-Sforza与中心合作练习曲多态性Humain在巴黎。与生物伦理学家工作,确保正常样本收集,来自世界各地的人类学家开始发送血液收集在1990年代。

斯坦福大学研究中使用的51个种群的选择主要是根据人类学家能够得到样品。费尔德曼和Cavalli-Sforza希望获得额外的人群样本的一天,这将增加的遗传多样性和亲缘的世界人口。

DNA HGDP是免费的。事实上,2月21日《自然》杂志发表的一篇论文,从一群由诺亚罗森堡博士,密歇根大学的遗传学助理教授和费尔德曼的前研究生,看着同样的样品和到达斯坦福研究许多相同的结论。

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