识别与基因调控有关的microrna在多发性骨髓瘤
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microrna的表达被定量实时PCR量化。基因表达和基因组分析数据生成Affymetrix寡核苷酸微阵列。重要的微阵列分析算法被用来研究差异表达记录。传统的统计数据被用来测试相关的意义。公共图书馆查询预测假定的microrna的目标。
记录被确认是特定于六个microrna的宿主基因(CCPG1,GULP1,EVL,TACSTD1,最高明的,TNIK)的平均变化表达不同的至少2倍的意思是检查数据集。评估相应的intronic种microrna的表达水平确定的表达水平之间的显著相关性最高明的,EVL,GULP1和相应的microrna mir - 335, mir - 342 - 3 - p,和mir - 561。
全基因组分析的20个HMCLs表示,三个宿主基因表达的增加相应的intronic microrna并没有与当地的拷贝数变化。
值得注意的是,microrna及其宿主基因过表达在初选的一小部分肿瘤对正常的浆细胞;然而,这一发现并不与已知分子骨髓瘤组。预测的假定的microrna的目标和相关的转录概况与主肿瘤显示最高明的/ mir - 335和EVL /mir - 342 - 3 - p可能发挥作用在浆细胞归巢和/或与骨髓微环境的相互作用。
intronic microrna的数据支持和宿主基因非独立的规范,可能有助于理解在癌症的生物作用。格兰作者所知,这是第一次证明管制的microrna的表达在MM,提供见解,可能导致新的生物标记物的鉴定和改变疾病的分子途径。
原文:Ronchetti等BMC医学基因组学2008年,1:37
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