识别有效的参考基因正常化RT qPCR人类脑组织基因表达数据

文摘

背景:基因表达在事后剖析人类大脑的研究有助于理解病理生理学的神经退行性疾病,包括阿尔茨海默病(AD)、帕金森病(PD)和路易体痴呆(下文)。实时定量PCR (RT qPCR)通常用于分析基因表达。使用RT qPCR结果的有效性依赖于准确的数据规范化。参考基因通常用于RT qPCR规范化数据。鉴于一些常用参考基因的表达改变在一定条件下,本研究旨在建立参考基因稳定表达于事后剖析脑组织从个人广告,PD或下文。

结果:本研究调查了8候选人参考基因的稳定表达,(泛素C(哥伦比亚大学),tyrosine-3-monooxygenase YWHAZ, RNA聚合酶II多肽(RP II), hydroxymethylbilane合成酶(hmb), TATA盒结合蛋白(真沸点),beta-2-microglobulin B2M, glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶(GAPDH)和琥珀酸脱氢酶complex-subunit, [SDHA])在小脑和内侧颞回6广告,6 PD, 6下文科目,随着5匹配控制使用RT qPCR (TaqMan (R)基因表达分析)。分析了基因表达稳定使用geNorm等级减少稳定在每一个疾病的候选基因。推荐最优数量的基因准确的数据标准化在每个疾病状态是由成对变异分析。

结论:本研究发现验证集的mrna适合于RT qPCR数据的规范化研究脑组织基因表达的广告时,PD,下文和控制对象。

这篇文章发表在《BMC分子生物学和是免费的访问。