Illumina公司宣布同行评议的出版物ChIP-Seq®Solexa研究技术
Illumina公司有限公司已经宣布,研究人员加州理工学院的和斯坦福大学医学院的,国家心脏、肺和血液研究所的美国国立卫生研究院在业界第一个使用Solexa测序技术与基因分析仪产生显著的染色质免疫沉淀反应测序,或ChIP-Seq结果在系统安装后的几个月内,研究结果发表在知名的同行评议期刊。这些研究发表在6月8日,2007年版的科学和5月18日2007期的细胞,分别。
在这两项研究中,调查人员使用Illumina公司Solexa测序技术来识别蛋白质与脱氧核糖核酸(DNA)在整个人类基因组。
研究结果表明,这种新一代技术提供了科学界扫描数百万结合位点的能力在一个通道的流动池10到30倍比ChIP-chip方法成本低。使用ChIP-Seq方法,研究人员还获得决议,特异性,信噪比芯片的选择。
“我们ChIP-Seq研究利用基因组序列分析仪产生数千万的能力读/运行,”理查德·m·迈尔斯说,博士,教授,斯坦福大学医学院的遗传学和关键作者科学出版物。
迈尔斯继续说道,“这让我们把芯片变成一个简单的计数测定,一个读每个分子DNA序列从样本映射到参考基因组在数以百万计的分子/样品。通过分析这些积极的“热门”的分布在整个基因组我们映射和学习新事物对成千上万的网站,有选择性地绑定到我们感兴趣的因素。这些数据的数量和性质意味着我们有特殊的位置分辨率和统计的信心。”
“我们兴奋应用其他类似“序列普查”的方法来测量和地图RNA表达、DNA化验修改,等等,”芭芭拉说,博士,教授,分子生物学和贝克曼研究所主任加州理工学院和关键科学论文作者。”这似乎是不可避免的,序列读取很快将共同为公司DNA和RNA的测量数字货币。”
根据发表在细胞5月18日,2007年,研究人员在NHLBI”表明,使用Illumina公司基因组DNA直接测序芯片分析仪是一种有效的方法映射组蛋白修饰的全基因组分布和染色质蛋白质的目标。”Investigators used the Solexa sequencing technology to generate genome-wide data for more than 20 epigenetic marks in human T cells.
”的科学和细胞的研究中,科学家们现在可以探索整个基因组,无论生物类型,和发掘丰富,新信息——轻松、迅速,和经济化,”约翰·西说Illumina公司的高级副总裁和总经理,DNA测序。
“ChIP-SEQ方法是改变科学家们观察dna蛋白质相互作用的方式,改变基因功能和调节,对许多复杂疾病的理解至关重要。”