Illumina公司提出了发展路线图扩展其基因组分析仪

Illumina公司公司公布了一项发展路线图基因组分析仪系统图的路径生成大于95碱基的高质量数据/ 2009年运行。

这个路线图,提出了次用户组会议在本周的基因组生物学和技术的进步(AGBT)会议上,概述了化学的进步,算法,将大大提高精度和硬件,读取长度,数据密度,和易用性。这些进展图表清晰和明显的路径研究人员产生25 x报道的人类基因组2009年不到10000美元。

“展示的创新步伐基因组分析仪使我们和最终用户开始雄心勃勃,新的全基因组测序项目,将对人类健康产生重大影响,特别是癌症,”大卫·本特利说DNA测序的Illumina公司副总裁兼首席科学家。

“目前我们可以产生大于25 x覆盖人类基因组的三个流动细胞;一年前,40多个流细胞被用来完成我们的第一个非洲基因组。到今年年底,我们预计产生相同的25 x覆盖在一个流动单元将收购的成本低于10000美元的人类基因组序列,”本特利说。

当前配置的基因组分析有可能生成超过15个碱基的高质量数据/运行。从这个基线,基因组的性能分析仪在2009年预计将增加大于6倍。

根据Illumina公司,提出实现这一增长将全年商业化在几个阶段,包括以下要素:

•化学进展包括新的测序和集群生成聚合酶使更快的运行时间和配对读取超过2 x100碱基对。这些进步也提高测序精度大于98.5% 2 x100配对端读取和99.9%为2×50配对端读取。

•硬件升级包括改善流电池座和更大的试剂冷却器提供增加输出和走开自动化读取至少100周期。这些硬件组件将包括基因组AnalyzerIIx升级装备,目前基因分析仪用户可以立即提高产出和提高自动化的系统。

•算法改进包括一个集群检测新方法将增产80%收益率高细胞密度流和改善basecalling准确性和更大比例的完美读取每运行。

•数据密度增加了使用半有序数组随后1微米和亚微米特征。这些有序阵列,结合阅读长度增加,预计收益率分别大于55和95 gb /运行。