Illumina将为英国研究小组进行大规模基因分型
Illumina公司有限公司宣布已签署基因分型服务协议,支持前列腺癌研究人员英国癌症研究中心.
根据这项价值近700万美元的协议条款,Illumina的服务团队将对至少4000名分类良好的前列腺患者和对照组进行全基因组基因分型(每个样本有550,000个单核苷酸多态性,或SNPs)。
第二阶段将涉及开发定制的12个样本的BeadChip,该芯片将能够分析每个样本的24000个snp,并用于至少8000个样本的基因分型。
这两个阶段都将使用Illumina公司的Sentrix®BeadChips和Infinium™Assay可选择使用相关的分析方法。
这是两个组织在过去六个月里签署的第二份大规模基因分型协议。
它的结构与2005年11月的一项协议密切相关,根据该协议,Illumina正在为英国癌症研究中心(cancer Research UK)对结直肠癌样本和对照进行基因分型。
Illumina的基因分型服务小组将支持由英国癌症研究资助的两个研究小组组成的研究前列腺癌遗传基础的合作所推动的科学工作。
其中一个研究小组是由罗莎琳德·伊尔斯博士领导的伦敦癌症研究所.
第二个研究小组将由英国癌症研究中心遗传流行病学部门的道格拉斯·伊斯顿教授领导剑桥大学.
这项工作的目的是研究常见遗传变异在前列腺癌病因学中的作用。
从这项工作中,希望在未来有可能设计和验证与前列腺癌易感性和疾病进展相关的生物标志物,并促进改进治疗方法的发展。
在评论最新的协议时,英国癌症研究的首席运营官Harpal Kumar说:“我们很高兴与Illumina的关系扩展到第二次基因分型研究,这既强调了我们对他们数据质量的信心,也强调了我们对癌症生物学和原因进行世界级研究的持续组织必要性。”
“我的同事和我坚信,这种类型的研究将极大地提高对前列腺癌的了解,从而改善癌症患者的预后。”
该项目的第一阶段将包括超过4000个对照和前列腺癌患者样本。每个样本都将用Sentrix进行基因分型®HumanHap550 BeadChip采用Illumina的Infinium™检测。
珠晶片的SNP含量主要来源于最近完成的研究中发现的高价值tagsnp人类基因组单体型图计划.
凭借全面的基因组覆盖和行业领先的数据质量,HumanHap串珠芯片旨在为大规模疾病关联研究提供卓越的性能。
除了识别潜在的生物标志物,英国癌症研究中心还将评估基因型数据,以检测和分析染色体畸变,如拷贝数变化和杂合性损失,这两者都可能为癌症发展的遗传机制提供线索。
Illumina总裁兼首席执行官Jay Flatley说:“我们很高兴继续与英国癌症研究中心合作,帮助他们的研究团队进一步了解癌症的遗传基础。”
“英国癌症研究中心正在通过一系列大胆的项目引领癌症研究,这些项目可能会加速识别致癌标志物、基因和途径,具有广泛的全球效益。”