Illumina公司进行大规模的基因分型研究

Illumina公司,公司已经宣布,它已经签署了一份服务协议,支持型多阶段结直肠癌研究人员由英国癌症研究。

数百万美元的协议扩展了多年,包括两个主要阶段。

在项目的第一阶段,Illumina公司服务集团将进行密集,全基因组的基因(500000单核苷酸多态性,或单核苷酸多态性,每个样本)至少4000 well-classified直肠癌患者和控制。

在第二个阶段,Illumina公司将在使用一个定制的10000个样本,基因型多试样BeadChip,使20000个snp /样品的分析。

两个阶段将使用Illumina公司的Sentrix®数组和英飞纳姆™试验选择采用相关分析方法。

Illumina公司型服务集团将支持协作推动科学的工作包括两个主要癌症研究这份研究分组在英国调查结直肠癌的遗传基础。

这项工作的目的是探讨常见的遗传变异在大肠癌症的病因。

Harpal Kumar,英国癌症研究中心的首席运营官,将这项研究描述为“完全符合我们的组织目标的世界级研究生物学和癌症的原因。”

“我们非常渴望与Illumina公司在这个项目上合作,我们相信,英国癌症研究结果将有助于更好的理解癌症和铺平道路改善癌症患者的生活质量,”Kumar表示。

项目的第一阶段将包括至少4000 well-classified大肠癌患者和控制。

每个样本将基因分型Sentrix HumanHap-1 BeadChip和Sentrix HumanHap-1S BeadChip使用Illumina公司的英飞纳姆试验。

两BeadChips SNP的内容主要来自高价值TagSNPs最近完成了人类基因组单体型图计划的确认。

在一起,这两个BeadChips将使每个抽样的超过500000个snp基因分型,与全面的基因组覆盖率和行业领先的数据质量。

第一阶段将主要关注:1)发现候选基因,可能带来对结直肠癌;2)绘制基因突变的患病率及相关危险因素在这些基因;和3)理解这些因素如何影响流行病学、或进展的疾病。

第一阶段数据的分析后,Illumina公司将开发一个定制的,多试样BeadChip,使20000个snp的研究使用英飞纳姆试验样品。

研究小组将分析数据来自10000多个样本的基因在定制BeadChip识别低流行率的目标,高效标记和功能重要的单核苷酸多态性表现出明确的协会结直肠癌和疾病易感性。

“我们非常高兴能与英国癌症研究中心合作,帮助他们的研究团队了解结直肠癌的遗传基础,”杰弗说,Illumina公司总裁兼首席执行官。

“据我们所知,这将是最大的和最丰富的基因研究的进行。”

研究设计是由HapMap-derived工具将允许Illumina公司执行非常高效的全基因组基因分型,提供爱丁堡和伦敦癌症研究小组统计力量重大发现。”