国际水果害虫基因组研究的目标

工作预计将加速基础和应用研究,导致更好的害虫监测和控制策略。

12月1日正式发表在《华尔街日报》G3(基因、基因组学、遗传学),开放获取研究一直在网上几周,吸引了全球的关注。

“支持基础研究和应用研究的重要害虫,果蝇suzukii,我们获得一个高质量的参考序列的基因组测序,”加州大学戴维斯分校的分子遗传学家乔安娜Chiu说昆虫和线虫学。邱教授和加州大学戴维斯分校的大卫开始部门领导的进化和生态基因组学从四个机构的合作研究团队。

基因组的发布和比较序列分析公开SpottedWingFlyBase门户网站可能会导致更多的特有的武器来战斗破坏性的害虫,赵说。科学家们观察其生物学行为,食物和气味的偏好,农药抵抗。

“许多研究人员正在努力研究这个昆虫的生物学基础和应用项目,我们希望我们的努力在我们的基因组数据以用户友好的门户网站将民主化序列数据和帮助促进每个人的研究,特别是那些没有专业知识的基因组序列分析,”她说。

发现翅果蝇,亚洲人于2008年在美国首先发现,造成经济破坏作物,如蓝莓、樱桃、黑莓和覆盆子。这只苍蝇产卵在成熟或成熟的水果,和发展中幼虫吃柔软的水果,严重的作物产量。

发现翼果蝇果蝇约1/16到1/8英寸长红着眼睛,胸腔淡棕色,黑条纹腹部。雄性有一个明显的黑点每翼。雌性没有点但有一个突出的,像产卵管钻井水果产卵。

赵与加州大学戴维斯分校的科学家们合作,俄勒冈州立大学,中国国家基因库和美国自然历史博物馆的580万美元项目的生物学和管理发现果蝇,由美国农业部的特色作物研究专项拨款俄勒冈州立大学昆虫学家沃恩•沃尔顿和一组调查人员包括加州大学戴维斯分校教授弗兰克Zalom昆虫和线虫学,谁是加州大学戴维斯分校研究员。

Zalom最近引入作为总统的美国近7000名成员的昆虫学会说,G3文章”提供了一个高质量的参考序列的果蝇suzukii,检查它的基因组和转录组的基本属性,和描述的基因组进化的模式与它的近亲。”

SpottedWingFlybase门户网站吸引了超过3000页面浏览量从20个国家,包括美国、法国、意大利、比利时、中国、西班牙、日本、德国和英国。

“鉴于这种令人印象深刻的反应和全球果蝇suzukii的重要性,我希望本文G3将成为高度引用,乔安娜赵作为中心人物在未来果蝇suzukii基因组研究相关的话题,例如杀虫剂解毒,有气味的接待和监管昆虫学,“Zalom说。

俄勒冈州立大学昆虫学家沃恩•沃尔顿,美国农业部的首席研究员格兰特说:“来自世界各地的科学家们感兴趣的知识被锁在果蝇的遗传物质。”他还指出,基因组工作可以减轻恐惧的国家希望美国进口水果,而不是害虫。通过发现苍蝇的独特基因签名,科学家们希望,DNA测试将很快确定ready-to-be-shipped水果含有发现翅果蝇幼虫。

加州大学戴维斯分校的团队包括乔安娜赵实验室和弗兰克Zalom实验室,在昆虫和线虫学,大卫开始的果蝇在进化和生态进化遗传学实验室。他们与沃顿和发现果蝇项目负责人琳达啤酒俄勒冈州立大学;从美国自然历史博物馆的欧内斯特·李;张Xuanting蒋和国捷中国资源库,深圳华大基因研究院。

其他加州大学戴维斯分校科学家参与这项研究包括Zalom实验室的博士候选人凯利美元,罗赞娜郭赵的实验室,以及博士后研究人员李赵,克里斯托弗•哈姆朱莉·m·Cridland和研究实验室技术员的佩罗Saelao开始。

SpottedWingFlyBase是专用的网络资源为果蝇suzukii基因组学还包括比较基因组分析果蝇suzukii与其他果蝇物种密切相关。