具有里程碑意义的基因研究旨在将常见的儿童癌症从地图上抹去
急性淋巴细胞白血病(ALL)是最常见的儿童癌症。现在,研究人员圣裘德儿童研究医院已经创建了一个路线图的基因突变出现在所有患者。
这项研究发表在自然遗传学,是第一个提供了一个全面的视图每所有亚型的遗传学基础。这项工作的目的是提供一个功能指导医生和科学家,增加我们对所有的理解和改善患者的结果。
“在这项研究中,我们能够全面定义循环地改变基因的数量和类型,在童年,”解释道Charles Mullighan共同通讯作者和医疗主任圣裘德Biorepository。“因为规模的研究中,我们可以发现许多新涉及的基因在白血病和癌症,没有报告,表明他们落入一些新的细胞通路。”
收集儿科所有样本的最大群体
大多数孩子被诊断为生存,由于研究的突破来自世界各地增加我们对疾病的理解。不过,一小部分患者没有回应治疗。研究人员假设,可以预测治疗结果通过研究差异基因组成癌症的这些不良反应者。这是证明了这一点以前的研究结果从圣裘德团队,这表明一个特定的单一基因错误就足以显著增加类型的白血病复发的风险,通常被认为是低风险的。
用更好的基因差异如何影响知识对癌症治疗的反应,医生在未来能够序列前病人的癌症治疗。病人可以接受个性化治疗定制,基于哪些将是有效的为他们的特定的基因档案。然而,这可能成为现实之前,我们需要知道哪些突变负责驾驶白血病发展通过创建一个基因“路线图”。
在当前的研究中,研究人员搜集样本超过2500儿童所有的病人,创建的最大队列类型出版(早期的研究收集的样本只有几百甚至更少)。一旦所有样本收集,分析使用新一代测序技术,如全基因组,whole-exome和转录组测序。
下一代测序技术是什么?
下一代测序(上天)是一个实验室的技术决定了序列的遗传组成DNA或RNA的代码。这些数据可以用于解决其变异与不同的疾病或条件。
椅子上的圣裘德计算生物学和共同通讯作者张博士历程解释了这种规模的研究的重要性:“这项研究表明数据的力量。如果你没有足够数量的患者样本,你缺乏统计发现司机在低流行率。一旦我们有能力,我们发现了一个新司机参与发展的子群。”
突变推动所有?
研究人员分析了测序结果发现突变他们发现的任何模式,画一个地图显示如何使用这些癌症发展和治疗可能是有效的。这个数据允许他们识别突变驱动的发展——平均每个儿童都样本有四个驱动突变。总共有376显著突变司机基因被确定在所有的样品,其中,70年以前从来没有与,和许多与意想不到的细胞过程。
共同通讯作者博士。(Stephen p .饥饿总结了研究的一些发现。“这项研究的结果清楚地定义不同基因亚型的,”他解释道。“其中一些基因亚型是未知的,我们还发现了共同的二、三级突变导致的发展。我们能够识别新的途径目标精密医学治疗可能提高治愈率和减少短期和长期治疗的副作用。”
研究人员还可以放在一起的一系列突变事件发生在许多情况下。通过观察细胞从所谓的超二倍体的b细胞(至少5比正常染色体),该团队使用计算技术来建立一个时间表的各种突变和染色体收益得到一些了解白血病的发展。这个时间表显示,在大多数的情况下,细胞经历一次“大爆炸”的变化在他们的早期癌变发展许多染色体收益发生在同一时间。在一个更有争议的发现,研究结果还表明,异常细胞然后积累更多突变通过紫外线辐射造成的损害。
本研究的数据使用了其他科学家在儿科癌症数据门户圣裘德云。
参考:布雷迪西南,罗伯茨公斤,顾Z,et al。小儿急性淋巴细胞白血病的基因组景观。Nat麝猫。。2022:1-14。doi:10.1038 / s41588 - 022 - 01159 - z
