具有里程碑意义的基因研究表明454测序系统免疫遗传学的力量

在线在自然医学杂志上发表的一项研究报告称,威斯康星州国家灵长类动物研究中心的研究人员研究了一种新的高通量方法解码一个最关键的基因组区域的免疫系统。

在这项研究中,他们使用了超深测序的基因组定序器FLX系统从454年生命科学,罗氏公司执行快速的主要组织相容性复合体(MHC)类我在猕猴的基因,一个共同的灵长类动物模型。

MHC是人类和猴子的拥有部分基因组,在免疫系统中起着至关重要的作用。健壮的基因分型方法对T细胞反应的研究是必不可少的,包括自身免疫性和传染病研究,移植和疫苗开发。

基因分型在非人灵长类动物的努力利用现有技术人员研究的努力了十多年的极端复杂性在猕猴基因组区域,甚至比人类。重要的是,研究表明,454测序系统可以显著改进传统Sanger测序方法通过启用新基因的发现,以前错过。

在最初的研究中,威斯康辛州人员能够描述MHC基因型在48个人猴子在单个运行工具。他们发现,平均而言,22不同MHC类1记录序列在每个猴子,证明有多少发现这些重要的模式生物的免疫反应。

“全面MHC基因分型有可能彻底改变利用非人灵长类动物传染病和移植研究和指导功能的免疫学研究,”罗杰·怀斯曼博士解释说,作者在威斯康星州国家灵长类动物研究中心。“丰富的基因组定序器生成的长序列读取FLX系统解决的关键等位基因密切相关,事实变得越来越明显,我们开始产生500碱基对扩增子使用早期访问GS FLX钛系列扩增子测序工具和软件。”

MHC地区最著名的基因是人类白细胞抗原(HLA)基因,编码的细胞表面蛋白负责区分自我和非自我细胞等抗原。理解一个人的HLA基因型尤为重要,在匹配的捐献者和接受者组织移植因为任何细胞显示一种异己分子HLA引起免疫排斥反应。

也许最令人兴奋的方面未来免疫基因分型的研究是其应用在人类的努力。新的测序方法不仅提供更全面的基因分型结果与现有的技术相比,它也可能是一个成本有效的解决方案。