使单细胞生物工作
正式宣布维尔康姆基金会桑格研究所之间的合作,欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和Fluidigm公司加速发展的单细胞基因组数据分析的新方法。
单细胞基因组学中心(SCGC)在校园威康信托基金会基因组将与现场Fluidigm高级职员,确保中心早期访问到最新的设备、工作流和基因组学和蛋白质组学的方法研究。
“因为我们提前获得最先进的技术,我们可以开发新的实验和计算方法,帮助我们了解什么是发生在我们每一个细胞,在细胞周期的不同时间点,”莎拉EMBL-EBI摄影师和桑格研究所博士说。“这真是一个新边疆——我们希望我们的工作能帮助技术成熟得更快,所以它可以帮助更多的人找到复杂的生物学问题的答案。”
除了技术进步,合作会使单细胞研究更容易更大的研究团体通过开发和传播新工作流,生物信息学工具和数据集。
Fluidigm之间的协作是建立在以前的工作和SCGC的创始成员。例如,摄影师组发现,免疫细胞产生类固醇来调节自己,知识基于mRNA-seq数据从单一细胞由Fluidigm技术。使用单细胞基因表达数据从Fluidigm C1TM单细胞的汽车准备系统和测序技术,约翰在EMBL-EBI Marioni的小组开发了一种新的统计方法,表明单细胞信使rna序列可用于确定真正的细胞明显均匀样本之间的差异。蒂埃里沃特,在KU鲁汶和教员桑格研究所的准会员,使用DNA测序在单细胞水平了解自发的DNA可以作为细胞分裂产生的变化。
SCGC“我们的工作是为革命在生物一起营造一个坚实的基础的理解,将来自单细胞分析,”罗伯特·C·琼斯说Fluidigm执行副总裁的研究和发展。”在一起,我们可以构建更好的信息学工具从大量的提取相关生物学单细胞RNA表达我们的系统产生的数据。我们也会寻找创新的方法来确定DNA、蛋白质、RNA,每个细胞的表观遗传状态和处理来执行在成千上万的细胞。”
这些高通量技术让研究人员探索细胞异质性在正常发育和疾病在单细胞水平,提供一个巨大改进当前的实践调查散装数以百万计的细胞。直到现在,科学家已经有限的能力来识别功能不同的细胞各亚群和理解他们的贡献为疾病如癌症的发展。DNA-seq和RNA-seq技术是开放新的机遇去发现和探索不同性质的细胞能以可能的最高分辨率。
