大规模并行技术协议宣布蛋白质组学分析

大规模并行技术,Inc .(大规模)已经宣布,它已经签订了合作协议科罗拉多大学开发和商业化的成就在蛋白质组学分析。

与马克•邓肯博士,丹佛科罗拉多大学的教授和健康科学中心(UCDHSC)、儿科部门、医学和细胞生物学和蛋白质组学主任共享资源、部门,和他的团队,这两组将大规模的并行处理软件技术专利蛋白质识别UCDHSC开发的软件应用程序。

分析软件用于识别蛋白质的串联质谱分析。蛋白质组学的目的是定义所有的蛋白质表达的一个细胞,器官或生物。

识别和充分描述人类蛋白质组拥有巨大的潜力来帮助临床医学,提高我们对人类生物学的理解。

使用疾病早期诊断的生物标志物,更好的疾病分类、预测和响应给定的治疗结果,并确定新的治疗和高质量的目标是通过蛋白质组学产生的一些潜在的好处。

“我们已经投入了大量的资源开发和验证该应用程序背后的科学,”邓肯说。

“因此,我们的应用程序提供高序列覆盖率,同时减少假阳性和阴性相比,现有的应用程序。”

“对我们的现实,然而,没有高性能计算资源,专业知识和创新大规模带来的表,这个应用程序不会实际使用由于其计算的要求。”

一旦证实,大量将有两个选择将解决全球市场研究人员并使其可用。

首先是通过大规模的生物技术虚拟权力中心——一个互联网访问,按需套件软件应用程序提供超级计算性能的PC价格。

第二个选择是许可解决生物技术和制药公司。

除了最初的蛋白质识别应用,大规模和UCDHSC共同努力确定和并行化其他关键承诺突破数据分析的应用程序目前抑制蛋白质组学领域的瓶颈。

“我们设想一套全面的蛋白质组学的应用程序将使突破从有针对性的个性化医疗疾病治疗,”斯科特·史密斯说,大规模的首席执行官。

“UCDHSC之间的合作协议,连同我们的第一个国家健康研究所授予应用程序只是一个开始,我们认为一个长期互利合作。”

大量的计算和相互的交流方法保持通信开销的增长速度,确定最大扩展效率,甚至接近于零处理节点增加,给成千上万的计算节点,这样每个计算机实现的最大功率。

大量的解决方案可以通过互联网访问,随需应变的超级计算机虚拟权力中心或本地安装。