意味着新的微数据分析方法给出更清晰的结果
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我们理解小分子核糖核酸在调节基因表达的重要性正在扩大,和我们的要求健壮的方法来衡量他们的表达水平。
现在一种新的方法在生物医学中心的开放获取基因组生物学》期刊上发表有助于研究人员更好地理解之间的微妙的相互作用微rna表达水平的差异和他们的目标基因。
后高度引用的方法分析逆转录定量PCR (RT-qPCR) mRNA表达数据记录,2007年发表在《基因组生物学,乔Vandesompele中心的医学遗传学,根特大学医院,比利时和他的同事创造了一个创新的、直接的和普遍适用的定量rt - PCR方法为小分子核糖核酸数据规范化。
研究人员还提供适当的工作流数据标准化大规模(整个miRNome)和小规模的microRNA在他们的论文中分析实验。
Vandesompele的团队异形430小分子核糖核酸以及18小RNA控制的独立组织样本集。他们评估的使用意味着所有表达的小分子核糖核酸的表达值给定的样本作为microRNA实时定量PCR的归一化因子数据,然后将这种方法与目前采用的方法依赖于一个或两个小RNA控制。
意味着表达式值优于当前标准化战略更好的降低技术变化和更准确地欣赏生理变化。此外,规范化使用小分子核糖核酸类似意思的表达值是平台独立的,密切模仿规范化使用意味着表达式的值。
“所有表达的小分子核糖核酸的意思表达价值执行比一个基于只有那些表达的小分子核糖核酸样本,“Vandesompele说。“这表明一个更准确的表示输入当所有小分子核糖核酸RNA波动。”
“微rna表达的变化通常很微妙但生物相关的,”皮特Mestdagh, Vandesompele工作方法的实验室。”因为小分子核糖核酸基因调节作用在不同的通路,管制microRNA表达会引发一连串的事件,改变细胞的生物学。因此,一个适当的标准化战略,使检测微小的变化是至关重要的,尤其是在处理异构病人样本。”
逆转录定量PCR (RT-qPCR)已成为首选的方法测量的准确性和特异性基因表达水平,为编码和非编码rna。然而,结果的准确性在很大程度上是依赖于有效的数据规范化。
现在一种新的方法在生物医学中心的开放获取基因组生物学》期刊上发表有助于研究人员更好地理解之间的微妙的相互作用微rna表达水平的差异和他们的目标基因。
后高度引用的方法分析逆转录定量PCR (RT-qPCR) mRNA表达数据记录,2007年发表在《基因组生物学,乔Vandesompele中心的医学遗传学,根特大学医院,比利时和他的同事创造了一个创新的、直接的和普遍适用的定量rt - PCR方法为小分子核糖核酸数据规范化。
研究人员还提供适当的工作流数据标准化大规模(整个miRNome)和小规模的microRNA在他们的论文中分析实验。
Vandesompele的团队异形430小分子核糖核酸以及18小RNA控制的独立组织样本集。他们评估的使用意味着所有表达的小分子核糖核酸的表达值给定的样本作为microRNA实时定量PCR的归一化因子数据,然后将这种方法与目前采用的方法依赖于一个或两个小RNA控制。
意味着表达式值优于当前标准化战略更好的降低技术变化和更准确地欣赏生理变化。此外,规范化使用小分子核糖核酸类似意思的表达值是平台独立的,密切模仿规范化使用意味着表达式的值。
“所有表达的小分子核糖核酸的意思表达价值执行比一个基于只有那些表达的小分子核糖核酸样本,“Vandesompele说。“这表明一个更准确的表示输入当所有小分子核糖核酸RNA波动。”
“微rna表达的变化通常很微妙但生物相关的,”皮特Mestdagh, Vandesompele工作方法的实验室。”因为小分子核糖核酸基因调节作用在不同的通路,管制microRNA表达会引发一连串的事件,改变细胞的生物学。因此,一个适当的标准化战略,使检测微小的变化是至关重要的,尤其是在处理异构病人样本。”
逆转录定量PCR (RT-qPCR)已成为首选的方法测量的准确性和特异性基因表达水平,为编码和非编码rna。然而,结果的准确性在很大程度上是依赖于有效的数据规范化。
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