代谢组学和基因组学能够改善病人的诊断

病人和家庭走进医生的办公室。他们希望最新的测试将揭示是什么导致病人的疾病和诊断奥德赛他们多年来一直经历。有一个准确的诊断也意味着也许有治疗,至少可以缓解病人的病情。

贝勒医学院,莎拉Elsea博士和她的同事们一直在努力提高他们的能力来识别被诊断出病症的遗传原因。他们的研究发表在《华尔街日报》医学遗传学。

“每10 9我们称为神经疾病患者,如发育迟缓和智力残疾,他们没有一个诊断,“Elsea说,贝勒和相应的分子和人类遗传学教授作者的工作。

识别被诊断出病症的遗传原因,研究人员寻找潜在的病人的基因组中有缺陷的基因。他们使用whole-exome测序,分析所有的基因编码的蛋白质。基因可能会有很多变体编码略有不同的版本相同的蛋白仍然携带他们的正常运转。但是一些变体可能编码缺陷蛋白可以导致疾病。具有挑战性的部分是确定一个特定基因的变异存在于一个病人是导致疾病。

“在某些情况下,变异缺失全部或大部分的基因,从而导致非功能性蛋白质。这表明变体是参与了疾病。然而,大多数基因变异涉及单个构件的DNA的变化。一个拼写错误的基因序列可能会或可能不会导致或有缺陷的或少功能的蛋白质,我们需要其他机制,如没有针对性代谢组学,以确定基因变化引起的疾病,“Elsea说,他也是生化遗传学贝勒遗传学的高级主管。

输入的诸多代谢组学

Elsea和她的同事们使用的诸多代谢组学提供额外的信息来帮助他们决定是否他们发现基因变异的病人是导致条件。

“没有针对性代谢组学让我们看的功能蛋白质编码基因变异的病人探索代谢异常可能与变体,“Elsea说。

在当前的研究中,研究者综合whole-exome测序和有针对性的代谢组学分析数据的一组170例。他们高兴地发现,代谢组学数据通知情况下的44%。

“分析让我们重新分类9变种可能良性,15变异可能引起疾病和三个致病变种。代谢组学数据证实21例的临床诊断,”Elsea说。”不仅对确认我们的分析是非常有用的一个变种引起的病症,但也排除变异引起的疾病。有一个更精确的诊断可以帮助确定一个更好的治疗条件,也为家庭提供了重要的信息关于复发风险。”

这种分析还艾滋病病人的诊断,可能有一种轻微的疾病,因为是广泛的和非常敏感的分析显示变量在整个代谢途径的影响。

“我们已经能够识别几例温和的疾病。我们综合分析之前,我们不会与疾病诊断这种情况下,但我们现在可以因为代谢组学揭示代谢异常,我们可以链接到患者的基因变异,”Elsea说。“这种方法大大提高了诊断,也增加了我们对这些条件的理解和临床表现的范围,我们可能看到的病人。”

研究人员希望他们的集成multi-omics分析将帮助其他病人提供诊断、澄清之前怀疑诊断或监视他们的治疗。

参考:Alaimo, j . T。Glinton, k . E。刘,N。肖,J。杨,Y。萨顿,v R。,,Elsea, s h (2020)。综合分析的代谢组分析和外显子组数据补充序列变异的解释、分类和诊断。医学遗传学。doi: 10.1038 / s41436 - 020 - 0827 - 0

本文从以下转载材料。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。