方法研究开发微生物群的功能

一个研究小组从图尔库生物科学中心,芬兰,已经开发了一种新方法通过宏蛋白质组学研究微生物群的功能。新方法研究带来了广泛的潜在的微生物群在一个新的、功能水平。肠道微生物群的功能的描述是中央在人类健康和疾病的研究以及疾病的预测、预防和治疗。先前的研究主要集中在编目微生物群的组成,但对人类肠道微生物群的功能。

蛋白质对于身体的重要功能至关重要。他们管理的大部分细胞功能,使复杂的细胞之间的相互作用及其环境。因此蛋白质的研究可以提供广泛的信息的不同的功能细胞。蛋白质分析可以利用广泛的医学研究,包括肠道微生物分析。

肠道微生物群对人体健康的重要作用和他们的角色在不同的疾病已经承认在最近几年发表的研究。领导的研究小组图尔库大学的教授劳拉值得信赖已经开发了一个新的大规模spectrometry-based方法,使广泛的复杂的微生物群蛋白质水平的研究样本。

“直到最近,研究微生物群强烈关注发现样品中微生物存在,但分析微生物群的功能仍是极具挑战性的课题。最近的技术进步但也深入探讨了功能启用。微生物群样品中蛋白质含量的研究就是这样的一个研究领域,使我们达到更广泛的微生物群的功能和动态的理解,”说,值得信赖。

最近开发的最新方法利用质谱技术和先进的计算方法,使更好的覆盖和重现性结果与以前的方法。

“我们已经开发出的新方法对于分析复杂的蛋白质数据产生比以前的方法更可靠的结果,”萨米Pietila博士后研究员说。

“当前使用的研究方法通常只分析最丰富的蛋白质,导致波动分析结果从一个到另一个地方。新方法分析了样本系统并产生可靠的结果没有这种类型的波动,”Pietila继续说。

计算方法已经发表的免费开源软件,研究社区。

“这是非常重要的对我们把这个新开发的方法对所有研究人员作为一个易于使用的应用程序可用。我们也准备进行进一步的开发和维护工具,”托米-芬兰语添加博士后研究员。

参考:Pietila年代,芬兰语T,值得信赖。引入非针对性data-independent收购宏蛋白质组学复杂的微生物样品。ISME COMMUN。2022;2 (1):1 - 8。doi:10.1038 / s43705 - 022 - 00137 - 0

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