微阵列序列捕获速度大型排序的有针对性的基因组区域

研究人员贝勒大学医学院和罗氏罗氏公司。发表了一个有效的和具有成本效益的方法的细节捕捉目标区域的基因组通过NimbleChip™微阵列在准备454高通量测序™。

技术,叫做“序列捕获”,允许快速和准确的浓缩成千上万的基因组区域,选择连续或分散,如片段的染色体或基因或外显子。这项研究名为“人类基因组位点的微阵列杂交的直接选择,“在线(打印前)出现在《自然》杂志上尿潴留。

根据当前序列捕获技术的成功,贝勒的人类基因组测序中心(HGSC)已经签约成为早期访问客户罗氏罗氏的序列捕获技术。

10月10日,2007年,克雷格·文特尔研究所的基因组医学和环境沃豪分公司(加工工厂)会议上,罗氏罗氏454生命科学,与理查德·吉布斯博士,教授,主任HGSC,将创建一个人类全基因组外显子组(所有外显子)微阵列,与整个人类外显子组测序的目标。

根据罗氏罗氏,其序列捕获技术使高性能目标成千上万的特定基因或位点使用单一芯片hybridization-based浓缩过程。贝勒所使用罗氏的基因组定序器FLX™系统为下游序列丰富基因组区域分析。454测序技术是适合这种有针对性的测序的方法,因为它长时间阅读长度和高度准确的读取。

”这种新技术将取代聚合酶链反应(PCR)对许多目的,”吉布斯说。“如果目标是整个基因组序列,这是朝这个方向迈出的一大步。”

自然Baylor1发表的论文的方法证明了序列捕获过程更简单,更准确,更有效和更具成本效益比以前使用的多重PCR准备基因组测序的样品。在一个实验中,超过6700个外显子(一起构成基因的遗传代码的一部分),进行了丰富和分析,以及连续的基因组区域500万基地。这将使用旧的技术至少6个月。

“我们很高兴有机会与贝勒HGSC科学家合作这一突破性技术的发展,”斯坦博士说玫瑰,罗氏罗氏总统。”这两个的组合罗氏technologies-NimbleGen和454 -有潜力改变DNA序列分析的市场。”