微生物签名的形式的乳腺癌解码
癌症是一种正常的细胞功能导致广泛出现在基因水平。这一事实已经知道了一段时间,但是越来越多的证据显示,人类微生物组,每个人内不同类型的微生物,可能发挥关键作用的癌症或甚至直接导致某些形式的。从佩雷尔曼医学院的一项新研究在宾夕法尼亚大学,由Erle s Robertson博士和James c . Alwine博士已经确定,第一次,一个协会之间的两个微生物签名和三阴乳腺癌(TNBC),疾病的最激进的形式。
“病毒和其他微生物可能有了更多的与癌症,至少癌症的传播和推广,比真的是已知的,“Alwine说,癌症生物学教授和副主任艾布拉姆森癌症中心的核心服务。使用一种称为PathoChip含60000分子探针的微阵列技术来识别所有已知的病毒和致病菌,真菌、寄生虫和其他微生物,Robertson微生物学教授和他的同事们从100年TNBC患者组织样本的筛选。
他们还调查了40匹配和非匹配控制(匹配控制从TNBC患者肿瘤组织;从健康的病人未匹配控制乳房组织)。
研究小组发现一个独特的微生物签名区分TNBC组织从正常样本,可以进一步划定为两大集群,一个主要病毒,另一主要是细菌、真菌和寄生虫。
“如果我们仔细看看这个,我们也可以找到一些较小的簇内的主要群体可能会给我们一些见解独特的标识符为个人在这些集群,”罗伯逊,也是全球癌症研究中心副主任,也是肿瘤的病毒学程序艾布拉姆森癌症中心。他解释说,研究小组发现“大约30生物体提供特定类型的签名给我们开发一个诊断工具的线索。”Co-authors Sagarika Banerjee, PhD, and Kristen Peck, from the Robertson lab, screened the organisms, and Michael Feldman, MD, PhD, and Natalie Shi from the department of Pathology and Laboratory Medicine, performed the pathology examinations to identify the TNBC cases.
最流行的病毒检测疱疹病毒,副痘病毒属,逆转录病毒,嗜肝dna病毒,多瘤病毒,乳头状瘤病毒。重要细菌签名includedArcanobacterium Brevundimonas、Sphingobacteria和Geobacillus,而真菌物种Pleistophora毛孢子菌病和鞭虫寄生生物Foncecaea和突出的标识之一。
Alwine强调这些和其他病原体的检测TNBC组织并不意味着他们实际上导致癌症。“有很多不同的方法来看看这个,”他指出。“这是可能的,一些生物我们看诱发效应,但是我们不知道。我们不能说,直到它被更多的全面测试实验。”One possibility is that the organisms could be adding something to the cellular microenvironment that helps damaged cells to become malignant or pushes them over the edge into cancer. Alternatively, certain organisms may simply find tumor tissue a favorable environment, without having any direct involvement at all with the cancer. "They might just be there because it's a good place to hang out," Alwine said.
在这两种情况下,找到一个不同的微生物签名与癌症有关的前景提出了新的诊断的可能性。“我们看签名作为一个潜在的能够诊断癌症,可能在早期阶段,“Alwine解释道。
“我们正在研究不同癌症发现是否有特定的签名和特定的癌症。”Robertson said. "We are also trying to come up with ways in which we can look at blood samples to see if we can potentially develop a test to detect these signatures, which might provide an early surveillance system for identifying patients who might be prone to developing these malignancies."
“微生物签名也可以有治疗意义,”罗伯森说。“这些微生物可以代谢药物,所以他们的存在可能会减少一些药物的效果和可能引导能力决定使用治疗的癌症,”Alwine说。研究小组下一步计划探讨这些有趣的前景与乳腺肿瘤组宾夕法尼亚大学医学。
“我们并不是想说,任何生物都直接导致癌症,”Alwine说。“我们试图找出特定癌症签名,这样我们就可以找出治疗方法,控制,或修改癌症或治疗肿瘤相关微生物,以防止这些恶性肿瘤首位。我们已经打开了大门,更具体地说看这些生物实际上是做什么。”
