新方法使脓毒症的早期诊断

是否激活或沉默基因,打破有缺陷的细胞或建立新的组织,我们的身体不断努力自我修复,甚至在生病的情况下。对抗疾病,之前我们的身体发出的信号,通常我们自己注意到疾病。这样的信号,例如,DNA分子释放人体自身的细胞,在血液中循环,最有可能被其他细胞作为消息刺激的防御反应。

图格拉茨计算生物技术研究所的研究人员已经确定了使者,来自奥地利的科学家一起工业生物技术中心(acib),格拉茨医科大学的和CNA诊断GmbH (Grambach施第里尔),已经开发出一种突破性的方法:使用这些内源性信号(生物标记物),可以诊断为败血症高精度两到三天前第一个临床症状发生。测试基于这种方法可以显著提高脓毒症患者的存活机会,降低脓毒症幸存者的负面影响。研究者已经出版的细节在这两篇论文”的评价基于主机的人类败血症的早期检测分子标记”和“循环DNA主要是由游离retrotransposable元素和non-telomeric卫星DNA”生物技术杂志(爱思唯尔)。

分类算法作为基础

“我们的团队已经确定了24生物标志物的细菌——或者fungal-induced脓毒症可以发现在早期阶段相比,当前使用的测试,使用新开发的分类算法,”解释Christoph w .靠计算生物技术研究所的主管你格拉茨。

对于他们的工作,bioinformaticians测序数据来自匿名等离子体研究小组提供的样品由罗伯特·克劳斯BioTechMed-Graz主任,在格拉茨医科大学的Peter Neumeister。样本来自人诊断为败血症细菌或真菌引起的,分别(这些病原体的血液中检测到),流感(一种疾病症状部分类似于脓毒症)或淋巴瘤,以及健康的个体。测序数据形成的发展的基础算法,用于识别标记,从而创建一系列前所未有的标记。“这个数据集可以用来区分人在脓毒症的早期阶段和那些早期临床症状从健康人群和其他疾病的人。”Sensen continues: "Within the patient group for which the markers were developed, the diagnostic accuracy was almost 90 percent in the period from two days before the first clinical signs until two days after diagnosis with the currently used diagnostic methods. In blind studies with patient groups that were not included in the marker development, the accuracy was still up to 81 percent." With the help of this method, sepsis can therefore be diagnosed much earlier than with any other diagnostic method.

基于主机的测试程序,审批过程已经开始

在的研究中,研究人员还开发出一种新形式的定量实时聚合酶链反应测试。PCR代表聚合酶链反应扩增核酸的方法。pcr测试已经在诊所中使用,例如covid-19的检测病毒的病人。这种测试通常用来放大DNA或RNA的传染病在血液、血浆或血清样本,如允许直接检测细菌或真菌败血症患者。针对大量的情况下可能影响病原体种类败血症然而,这只能是一个非常有限的范围内对脓毒症患者,因此非常不精确。格拉茨的新开发的测试组,另一方面,着重于身体的信号,代表所有细菌和真菌败血症的发生情况。这些因此可以用更高的测量精度,也提前2 - 3天的直接检测病原体。

在美国批准在美国食品和药物管理局(FDA)在华盛顿已经通过510 k申请审批流程和临床试验已经开始。批准在欧洲刚刚开始工作。Christoph w .靠希望测试很快就会大规模使用。“然而,日冕大流行正在我们的时间表的炉子上,随着美国医院当然不能够供应血浆样品一段时间由于现状。”

Bernd Nidetzky,全封闭的奥地利工业生物技术中心(acib)评论说:“发展的快速和有效的诊断程序,如下面败血症的早期检测方法,是一个新的领域,在acib,我们建立在当前融资阶段的我们的能力中心。我们很高兴这个工作已进入临床试验阶段如此之快!”

寻求进一步的血浆样本

与此同时,来自中国的数据显示,即使是covid-19严重的晚期疾病患者经常有脓毒症作为一个次要的疾病。靠和他的团队都是配合更感兴趣的生物银行如BBMRI-ERIC和医院能够提供团队在格拉茨血浆样本Covid-19病人。因为根据靠:“脓毒症疾病的预测研究项目的基础,我们应该能够开发更快的诊断工具的识别高危患者和早期干预的策略在脓毒症的迹象,可用于未来流行病减少这些影响的感染的后果。”

本研究项目是固定在人类和生物技术领域的专业知识和信息,通信和计算,两个五战略焦点的格拉茨大学的技术。参与人员是BioTechMed-Graz——地中海Uni格拉茨的研究合作,你格拉茨和格拉茨大学技术在生命科学领域。

引用:乌尔里希,E。Heidinger, P。全音阶,J。维拉诺瓦,L。、Grabuschnig年代。Bachler, T。,。靠,c . w . (2020)。评估基于主机的人类脓毒症的早期诊断的分子标记。生物技术杂志,310,80 - 88。doi: 10.1016 / j.jbiotec.2020.01.013

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